相分離或者說相變（Phase separation比驻，Phase Transition）是目前比較火的一個研究領(lǐng)域，已有的研究表明相分離在細(xì)胞中普遍存在认轨，與基因組的組裝绅络、轉(zhuǎn)錄調(diào)...
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火起來的“相分離”是什么玖瘸？ -
用pathview包給KEGG pathway涂色
前幾天有個客戶給過來一個需求，簡單說就是一堆基因列表附帶數(shù)值嘁字，需要將其按照數(shù)值不同涂色在KEGG pathway上恩急。 這個活兒我還真沒干過，記得KEGG官網(wǎng)上有工具纪蜒，去看了...
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samtools衷恭，bedtools1 samtools ? SAM全稱是Sequence Alignment/Map, 是目前最常用的存放比對或聯(lián)配數(shù)據(jù)的格式。無論是重測序纯续，還是轉(zhuǎn)錄組匾荆，還是表觀組， 幾乎所有...
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轉(zhuǎn)錄組入門(6)： reads計數(shù)要求 實現(xiàn)這個功能的軟件也很多杆烁，還是煩請大家先自己搜索幾個教程牙丽，入門請統(tǒng)一用htseq-count，對每個樣本都會輸出一個表達(dá)量文件兔魂。需要用腳本合并所有的樣本為表達(dá)矩陣烤芦。參考...
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轉(zhuǎn)錄組入門（7）：差異表達(dá)分析這個步驟推薦在R里面做，載入表達(dá)矩陣析校，然后設(shè)置好分組信息构罗，統(tǒng)一用DEseq2進(jìn)行差異分析，當(dāng)然也可以走走edgeR或者limma的voom流程智玻∷爝螅基本任務(wù)是得到差異分析結(jié)果，進(jìn)...
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原始數(shù)據(jù)下載的幾種方法
How to download All Sra data At Once SRA: Sequence Read Archive: It belongs to NCBI (Na...
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處理conda安裝工具的動態(tài)庫問題——解決記錄問題記錄 在conda的某工作環(huán)境下使用rmats2rmats2sashimiplot作圖的時候吊奢，發(fā)現(xiàn)有一個報錯：無法找到libcrypto.so.1.0.0盖彭，我查看了游一下...
