趙會成

可能的原因： 自己定義了一個csv.py文件

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@一條生物狗 建議百度

Beta多樣性常用距離的區(qū)別

Bray-Curtis與Unifrac距離的區(qū)別：Unifrac考慮物種信息，計算依賴進化樹文件 Weighted 和Unweighted Unifrac距離的區(qū)別：是否考慮...

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趙會成

@lclovefeifei 哪里報錯了

根據(jù)barcode拆分測序數(shù)據(jù)

擴增子測序不同于其他高通量測序項目，擴增子測序往往樣品量較大陶珠，但單個樣品的數(shù)據(jù)量要求不高（因為僅僅研究擴增區(qū)域的序列）粱锐。為了節(jié)約成本旺矾，研究者們通常會把多個樣品混在一個文庫援岩，并...

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趙會成

@易拉罐000 什么情況

2018-04-17宏基因組實戰(zhàn)qiime2-201802（三）去除引物和Barcode

這一步我也是走了很多彎路啊贮折，之前沒有去掉引物和barcode遍坟，所以跑程序經(jīng)常斷掉拳亿。 我還在論壇發(fā)了一個帖子詢問https://forum.qiime2.org/t/self-...

小鄭的學(xué)習(xí)筆記

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趙會成

rpm -qa|grep jdk 卸載所有已安裝的openjdk，查出幾個就卸載幾次 yum -y remove java-1.8.0-openjdk-1.8.0.65-3....

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yum install epel-release yum install R

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https://www.pianshen.com/article/30291899280/#_43 https://blog.csdn.net/ruby912/article...

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write(capture.output(變量名),"examp.txt")

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awk '{for(n=1;n<=NF;n++)t[n]+=$n}END{for(n=1;n<=NF;n++)printf t[n]" ";print"\n"}'

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library(taxonomizr) # read.names.sql('names.dmp','accessionTaxa.sql') # read.nodes.sql(...

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Stopping - no ASV ids overlap between input FASTA and sequence abundance table 刪掉qiime1...