hifiasm是一個能有效利用PacBio HiFi測序技術(shù)秤标，在分型組裝圖(pahsed assembly gprah)中可靠的表示單倍體信息的算法五督。 流程介紹 hifias...
發(fā)簡信
IP屬地：云南
-
hifiasm對HiFi PacBio進行組裝 -
-
用JBrowse搭建基因組瀏覽器寫在前面 JBrowse，可以把它理解為一個網(wǎng)站（網(wǎng)頁）汰翠，只不過使用它不再需要從 HTML 和 CSS 寫起龄坪，也不用 JS 來編寫各種 function。其次它的功能是用來展...
-
NCBI gff/gff3 轉(zhuǎn)換為 gtf 格式
適用于 NCBI 數(shù)據(jù)庫中 gff 格式文件轉(zhuǎn)換為 gtf 格式间聊，使用 perl 代碼實現(xiàn)：
-
空間轉(zhuǎn)錄組介紹疫情當前，我們延緩了返校笋熬，延緩了復工热某，但絲毫沒有阻擋我們追求上進的心。居家隔離的日子突诬，各個公司爭相推出滿滿的線上培訓課表苫拍，雖然進不了實驗室芜繁，但是大腦被這知識盛筵喂得飽飽的旺隙。而...
-
生物信息培訓資料
-
The Machine Learning Summer School
Video Log (vlog) A vlog is a short clip that shows impressions from our participants, o...
-
Note: Introduction to Machine Learning - 01 - Baby steps towards linear regressionRecommended book: Mathematics for Machine learning (free online): https://mml-book.gith...
-
資源帖：National Bioinformatics Infrastructure Sweden的github
NBIS（National Bioinformatics Infrastructure Sweden）的github有許多不錯的資源：https://github.com/N...
-
資源帖：Population genetics and genomics in R
Population genetics and genomics in Rhttps://grunwaldlab.github.io/Population_Genetics_...
-
資源帖：https://ivanek.github.io/introductionToR/
Lecture with exercises (2 CP) / Vorlesung mit übungen (2 KP)：https://ivanek.github.io/i...
-
我要測多少ＸPacBio數(shù)據(jù)來完成基因組組裝項目蔬捷？
經(jīng)常遇到的一個問題是，我需要多少Ｘ（Coverage）的數(shù)據(jù)來完成一個基因組的組裝項目榔袋。通常你會得到的答案是越多越好周拐。那么多少是比較合適的呢？ 今天我們介紹一個PacBio的...
-
本人從事生物信息數(shù)據(jù)分析多年，留學美國多年吏够，目前在高校專業(yè)從事生物信息數(shù)據(jù)分析工作勾给。這里主要分享本人的分析和生活經(jīng)驗滩报。
