240 發(fā)簡信
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  • QIIME2-上游分析

    好久沒更了弦疮,這半年心情很糟糕璧榄,也在不斷地調(diào)整自己。希望借助更新來轉(zhuǎn)移一下注意力,畢竟啥都沒有學(xué)到的知識重要~~~ 剛接觸微生物組這個領(lǐng)域的時候,就看了Rob Knight的一...

  • qc-數(shù)據(jù)處理與質(zhì)控

    獲得原始數(shù)據(jù)之后,需要對單端序列或雙端序列進行引物的去除倒彰、序列拼接以及序列質(zhì)控 Cutadapt 該軟件我經(jīng)常用來切除Primer,甚至切序列也很絲滑 Cutadapt — ...

  • qc-數(shù)據(jù)下載與格式轉(zhuǎn)換

    在進行上游分析之前蔑赘,我們需要進行原始數(shù)據(jù)的獲取狸驳,其中就包括去各大數(shù)據(jù)庫下載原始數(shù)據(jù) 1. 原始數(shù)據(jù)的下載 wget 批量生成數(shù)據(jù)鏈接再下載[https://zhuanlan....

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    2023,繼續(xù)前進

    如果用一個詞來形容我的2022年缩赛,那就是積累耙箍。在生信方面有了積累,在R語言統(tǒng)計分析方面有了積累酥馍,在科研方面有了積累辩昆,在生活上也有了積累。過程當(dāng)中旨袒,雖存在不足汁针,但整體來看术辐,我對...

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    R語言之經(jīng)驗分享

    自己也正在R語言的學(xué)習(xí)道路上前行,還有很多沒有接觸過的知識盲區(qū)施无,因此決定記錄一下自己所看到和所學(xué)到的一些前輩經(jīng)驗辉词。 《莊閃閃的R語言手冊》 這個公眾號我在之前就分享過,可能是...

  • 每日英語學(xué)習(xí)(三)

    2022.12.24 Extremely important/super important/very important/couldn't be more importan...

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    2022-12-22時間序列分析

    猶記得大學(xué)那會兒猾骡,基本上每年寒暑假都要參加數(shù)學(xué)建模競賽瑞躺,書買了不少,題做了不少兴想,但每次只選自己能看得懂的幢哨,稍微難一點就糊弄過去甚至是直接放棄,所以到最后仍然是一個代碼不會編嫂便、...

  • 每日英語學(xué)習(xí)(二)

    2022.12.8 Her accent is always a stubborn compass pointing her toward home. March towar...

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    2022-12-14判別分析

    就在大家都在社交平臺上各種“陽”言“陽”語的時候捞镰,俺不幸地中招了,??????毙替,俺“楊過”了岸售,但是只希望俺從此以后能夠“楊迪”,因為這痛苦的幾天真心不想再經(jīng)歷一遍?????? OK蔚龙,言歸...

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    2022-12-09對應(yīng)分析&典型相關(guān)分析

    對應(yīng)分析(Correspondence analysis)是因子分析的進一步推廣冰评,它是利用降維的思想把R型(對變量或指標(biāo))因子分析和Q型(對樣本)因子分析統(tǒng)一起來,利用過渡矩...

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    2022-12-08聚類分析

    鐺鐺鐺木羹,好幾天沒更的我又回來了,沒錯解孙,俺就是那種組會前發(fā)奮努力坑填、組會后瘋狂摸魚的卑微打工人~~~ 今天,要學(xué)習(xí)的是聚類分析弛姜。 聚類分析(Clustering analysis...

  • 每日英語學(xué)習(xí)(一)

    考慮到出國以及跟組里外國同事溝通的需要廷臼,英語的學(xué)習(xí)準備重新開始~~~ 2022.12.1 Each step has been a renovation of sorts ...

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    2022-12-04主成分分析

    多元統(tǒng)計分析(Multivariate statistical analysis)是多變量的統(tǒng)計分析方法苍在,與多元回歸分析不同,回歸分析是要區(qū)分出自變量和因變量荠商,并需要對因變量...

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    文獻清單(四)

    最近聽了好幾個有關(guān)生態(tài)研究的講座寂恬,自己研究的微生物群落本身也是一種生態(tài)系統(tǒng),研究方法也都大同小異莱没,因此初肉,決定看幾篇生態(tài)方面的文章長長見識,而這些文章基本上都是基于大尺度的研究...

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    R語言之相關(guān)性熱力圖

    最近學(xué)習(xí)了好幾種畫相關(guān)性熱力圖的包饰躲,為了更好地運用這些包牙咏,決定整理一下~~~ 1. GGally包 準確地來說臼隔,可以利用該包當(dāng)中的ggpair()函數(shù)來計算相關(guān)系數(shù)以及繪圖,...

  • 機器學(xué)習(xí)初步-西瓜書

    爭取一個月把周志華老師的西瓜書以及課程視頻啃完妄壶。 1. 緒論 科學(xué)是什么摔握、為什么技術(shù)怎么做工程做得多快好省應(yīng)用拓展 機器學(xué)習(xí):目前主要研究智能數(shù)據(jù)分析的理論和方法。 典型的機...

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    2022-11-28第五章回歸分析

    使用lm()函數(shù)建立多元線性回歸模型丁寄,使用glm()建立廣義線性回歸模型盒发。 廣義線性模型之泊松回歸[https://blog.csdn.net/qq_44638724/art...

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    jupyter之IRkernel

    問題的起因在于我并不是我們組服務(wù)器的管理員以及師兄不定期更新base中的R版本,這些都給我造成了很多bug狡逢。之前對這些bug視而不見宁舰,因為總能夠通過一些彎彎繞繞的方法解決,但...

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    R語言之?dāng)?shù)據(jù)處理(二)

    數(shù)據(jù)屬性變換是數(shù)據(jù)預(yù)處理的一種重要方法奢浑。接下來介紹幾種無量綱化數(shù)據(jù)預(yù)處理的方法蛮艰。 1.1 數(shù)據(jù)中心化 數(shù)據(jù)中心化,是指變量減去它的平均值雀彼,即 1.2 數(shù)據(jù)標(biāo)準化 數(shù)據(jù)標(biāo)準化壤蚜,...

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生信工作者,但有一顆生統(tǒng)的心
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