七白七白七七白

一猜年、HiC-Pro 簡(jiǎn)介 HiC-Pro是目前比較流行的HiC數(shù)據(jù)標(biāo)準(zhǔn)化處理工具之一抡锈，其流程主要分為6個(gè)步驟，比對(duì)乔外、過(guò)濾HiC比對(duì)結(jié)果床三、檢測(cè)有效HiC序列、結(jié)果合并杨幼、構(gòu)建Hi...

七白七白七七白

學(xué)習(xí)目標(biāo) 學(xué)習(xí)用DiffBind流程評(píng)估兩個(gè)樣本間的差異結(jié)合區(qū)域 用PCA評(píng)估樣本間的關(guān)系 評(píng)估不同工具得到的差異peaks的一致性 評(píng)估差異peaks富集的工具 ATAC-...

七白七白七七白

ggplot2包提供了分組和小面化（faceting）的方法。分組指的是在一個(gè)圖形中顯示兩組或多組觀察結(jié)果旧烧。小面化指的是在單獨(dú)影钉、并排的圖形上顯示觀察組。ggplot2包在定義...

七白七白七七白

基本數(shù)據(jù)管理 fix(leadership)來(lái)調(diào)用一個(gè)交互式的編輯器掘剪。然后單擊變量名平委，然后在彈出的對(duì)話框中將其重命名 或通過(guò)names()函數(shù)來(lái)重命名變量。例如：names(...

七白七白七七白

圖形初階 通過(guò)執(zhí)行如plot()夺谁、hist()（繪制直方圖）或boxplot()這樣的高級(jí)繪圖命令來(lái)創(chuàng)建一幅新圖形時(shí)廉赔，通常會(huì)覆蓋掉先前的圖形。如何才能創(chuàng)建多個(gè)圖形并隨時(shí)查看每...

七白七白七七白

R語(yǔ)言介紹 help("foo")或?foo 查看函數(shù) foo 的幫助（引號(hào)可以省略）example("foo") 函數(shù) foo 的使用示例（引...

七白七白七七白

3.1 正則表達(dá)式 正則表達(dá)式 (regular expression) 是用來(lái)做模糊匹配的匾鸥，匹配符合特定模式的文本蜡塌。最早來(lái)源于 Unix 系統(tǒng)中的 sed 和grep 命令...

七白七白七七白

Linux 下軟件安裝相關(guān) 2.1 文件屬性和可執(zhí)行屬性 2.1.1 文件屬性 文件屬性 rwx 中 r 表示 read (數(shù)字表示為 4)、w 表示 write (數(shù)字表示...

七白七白七七白

df -h ：查看硬盤有多大勿负，有多少可用空間 cat是一個(gè)命令馏艾，主要用來(lái)查看文件；在這與 *<<END *連用用于讀入大段數(shù)據(jù)奴愉。輸入 cat <<END 之后琅摩，回車，會(huì)看到終...

七白七白七七白

BLAST采用了一種局部序列比對(duì)的算法分析兩個(gè)序列中的相似區(qū)域志膀，并計(jì)算統(tǒng)計(jì)顯著性。主要包括四大類：1. Nucleotide BLASTblastn: 將待查詢的核酸序列及其...