文章鏈接：Markdown基本語法[http://www.reibang.com/p/191d1e21f7ed] Markdown是一種純文本格式的標(biāo)記語言浴栽。通過簡單的標(biāo)記...
IP屬地：上海
-
MarkDown編輯器的用法 -
Python深度學(xué)習(xí)（三）神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)入門本章涵蓋了神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)的核心組件Keras概論設(shè)置深度學(xué)習(xí)工作環(huán)境使用神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)來解決基本分類和回歸問題 本章旨在讓你開始使用神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)來解決實(shí)際問題摊趾。您將鞏固從第2章的第一個(gè)實(shí)際示...
-
Python深度學(xué)習(xí)（二）在我們開始之前:神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)的數(shù)學(xué)構(gòu)建模塊本章涵蓋了神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)的第一個(gè)例子張量和張量操作通過反向傳播和梯度下降的神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)學(xué)習(xí)方式 理解深度學(xué)習(xí)需要熟悉許多簡單的數(shù)學(xué)概念:張量契邀、張量運(yùn)算胎许、微分柑司、梯度下降等等踊餐。我們在這一章...
-
細(xì)胞通訊實(shí)戰(zhàn)演練參考鏈接：CellPhoneDB官方文檔[https://www.cellphonedb.org/explore-sc-rna-seq]單細(xì)胞數(shù)據(jù)高級分析——解碼細(xì)胞通信網(wǎng)絡(luò)...
-
GSE83521/GSE89143去除批次效應(yīng)老大在群里出的題藕漱，說感覺這個(gè)熱圖很詭異欲侮，然后中間我自己沒有用boxplot查看數(shù)據(jù)的表達(dá)量，對于數(shù)據(jù)不能有正確的認(rèn)識肋联，導(dǎo)致一開始的deg的logFC都沒有達(dá)到正負(fù)1的威蕉，最重要...
-
第37周-藥物反應(yīng)可以由基因組特性預(yù)測
藥物反應(yīng)可以由基因組特性預(yù)測 2015發(fā)在BMC Cancer的文章：Anticancer drug sensitivity prediction in cell lines...
-
單基因的腫瘤細(xì)胞系表達(dá)怎么看？CCLE告訴你泛癌的基因表達(dá)量一般可以用TCGA和GTEx實(shí)現(xiàn)橄仍，但是腫瘤細(xì)胞系一般用CCLE臨床生信之家[https://www.aclbi.com/static/index.html#/...
-
wilcox.test 進(jìn)行 RNAseq 差異表達(dá)基因分析
如果拿到的表達(dá)譜不是原始的read counts數(shù)據(jù)而是TPM值忘伞，就不能用包（比如DESeq2）來進(jìn)行差異表達(dá)基因分析。我們可以手動(dòng)用wilcox.test 函數(shù)手動(dòng)進(jìn)行分析...
