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在生物學(xué)和植物學(xué)研究中讥电，地圖作為展示物種分布女仰、分析生態(tài)環(huán)境關(guān)系以及追蹤動態(tài)變化的重要工具猜年，具有不可或缺的作用抡锈。 通過地圖，研究人員能夠直觀地呈現(xiàn)植物物種的地理分布范圍乔外，深入探...

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這是我看別人數(shù)據(jù)畫的床三，比一般的火山圖好看，那我們用上次的數(shù)據(jù)試一下杨幼。 1撇簿、上代碼，簡單處理一下數(shù)據(jù)即可繪圖 2差购、出圖（代碼正常運行四瘫，數(shù)據(jù)自己調(diào)整啦~） 3、完畢 生物信息學(xué)領(lǐng)...

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一、文獻 WGCNA（Weighted Gene Co-expression Network Analysis稳析，加權(quán)基因共表達(dá)網(wǎng)絡(luò)分析）是一種用于挖掘高維基因表達(dá)數(shù)據(jù)的系統(tǒng)生...

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火山圖（Volcano Plot）是一種常用于生物學(xué)洗做、醫(yī)學(xué)和基因組學(xué)等領(lǐng)域的數(shù)據(jù)可視化方法，特別是在差異表達(dá)分析中彰居。它通過橫坐標(biāo)和縱坐標(biāo)來展示每個基因的變化情況诚纸，使我們可以一...

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SNP密度圖是一種常用的遺傳學(xué)數(shù)據(jù)可視化工具，主要用于直觀展示單核苷酸多態(tài)性（SNP）在基因組上的分布密度陈惰。 通過該圖畦徘，研究者可以有效地分析SNP在不同染色體或基因組區(qū)域的分...

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一、力導(dǎo)向布局（Force-directed Layout）： 力導(dǎo)向布局可以通過模擬物理力（例如斥力和引力）來擺放節(jié)點抬闯，使得相互作用較強的蛋白質(zhì)會被拉得更近井辆，反之則相隔更遠(yuǎn)...

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蛋白質(zhì)互作網(wǎng)絡(luò)可以幫助我們探索基因家族與哪些蛋白相互作用，挖掘出豐富的信息画髓。不僅限于基因家族掘剪，差異表達(dá)基因平委、免疫奈虾、脅迫、藥物響應(yīng)相關(guān)基因等廉赔，都能通過PPI分析發(fā)現(xiàn)許多有趣的故...

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為了提取所有擬南芥（Arabidopsis thaliana）WRKY基因的ID肉微，我們可以使用Ensembl Plants或TAIR數(shù)據(jù)庫提供的工具，或者直接從相關(guān)的基因組數(shù)...