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    【分子對接】可視化PyMOL學(xué)習(xí)(一)

    以前總是用pymol進(jìn)行了3D結(jié)構(gòu)的顯示摧茴,但是對于具體操作細(xì)節(jié)和結(jié)果的處理不是很懂兴猩,需要系統(tǒng)的學(xué)習(xí)一下。 下圖可以整體看出PyMOL窗口界面的劃分: 打開PyMOL,點(diǎn)擊1....

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    6??蛋白質(zhì)序列的功能信息分析2:基于蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)域domain和功能位點(diǎn)分析

    [序列比對和序列特征分析總目錄](http://www.reibang.com/p/878f2b2495ae 結(jié)構(gòu)域domain比較抽象,屬于蛋白質(zhì)構(gòu)象中二級結(jié)構(gòu)和三級結(jié)構(gòu)...

  • 2023-03-22 幾個預(yù)測蛋白結(jié)構(gòu)涂身、理化性質(zhì)的在線工具

    1.預(yù)測理化性質(zhì):分子量(Da)、等電點(diǎn)(PI)\不穩(wěn)定系數(shù)(Instability index)搓蚪、親水指數(shù)(Grand average of hydropathicity-...

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    RoseTTAFold-蛋白質(zhì)預(yù)測的“平凡之路”

    在個人筆記本win10自帶子linux系統(tǒng)下蛤售,運(yùn)行基于CPU運(yùn)算的RoseTTAFold 避開uniref30、BFD這兩個超大數(shù)據(jù)包的下載及解壓 提供便捷的pyRosett...

  • 蛋白質(zhì)的可視化妒潭,預(yù)測模擬和分子互作(一)

    先來一張圖悴能,總結(jié)一下 蛋白質(zhì)的結(jié)構(gòu)描述 基因序列->氨基酸->組合表達(dá)成結(jié)構(gòu)->氨基酸脫水縮合形成肽鏈,肽鏈折疊形成三級結(jié)構(gòu)以后才能發(fā)揮作用雳灾。 蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)預(yù)測的原理 通過一堆...

  • 你好老師阱持,我想請問一下我在Robetta在線網(wǎng)站上選擇RoseTTAFold的建模方法夭拌,需要我提交一個MSA文件,我按照你文件里說的HHblits上進(jìn)行操作紊选,最后我是保存Query Template MSA下的文件還是Query MSA下的文件呢啼止?因?yàn)槟恼轮刑岬绞荙uery Template MSA道逗,但是文章的圖片里面界面是Query MSA兵罢,我不確定是用下載哪一個了,麻煩您看到回復(fù)一下我滓窍,感謝老師

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