發(fā)簡信
IP屬地：陜西
-
文獻(xiàn)閱讀集錦 | 泛基因組
2023 年 Nature Genetics | 橙超級泛基因組揭示柑橘屬和柑橘亞科植物起源并鑒定調(diào)控果實(shí)檸檬酸積累的關(guān)鍵基因[https://...
-
11 篇 Science 連發(fā)潜圃！解析基因組的關(guān)鍵之處件甥，揭示人類健康和疾病的相關(guān)信息導(dǎo)讀 從兩克重的大黃蜂到重達(dá)數(shù)噸的鯨魚袜腥，地球上存在著包括人類在內(nèi)的豐富的物種套么，在過去的漫長時間里，它們幾乎適應(yīng)了地球上的所有環(huán)境纳寂。其中衫哥，哺乳動物...
-
MODA創(chuàng)刊號｜未來農(nóng)業(yè)的100個重要問題在農(nóng)業(yè)問題上，世界正處于一個十字路口悲关。全球人口持續(xù)增長谎僻，對食品的需求也在不斷增加，這給我們的農(nóng)業(yè)資源和實(shí)踐帶來了巨大壓力和挑戰(zhàn)寓辱。因此艘绍，我們在全球...
-
scRNA-Seq | 多樣本Seurat+CCA整合一、前言 左邊的圖簡單地把多個單細(xì)胞的數(shù)據(jù)合并在一起秫筏，不考慮去除批次效應(yīng)诱鞠，樣本之間有明顯的分離現(xiàn)象。右邊的圖是使用算法校正批次效應(yīng)跳昼，不同的樣本基...
-
scRNA-Seq | 單細(xì)胞亞群合并與提取本文涉及：亞群合并般甲，亞群提取，亞群細(xì)分鹅颊，亞群抽樣 一般來講敷存，不同亞群的細(xì)胞具有不同的功能，因此亞群分析對于研究十分重要堪伍，會影響后續(xù)分析結(jié)果锚烦。 進(jìn)...
-
scRNA-Seq | SCENIC 推斷基因調(diào)控網(wǎng)絡(luò)和細(xì)胞類型轉(zhuǎn)錄因子 (transcription factors, TFs) 是直接作用于基因組，與特定DNA序列結(jié)合 (TFBS/motif) 帝雇，調(diào)控D...
-
scRNA-Seq | Seurat的三種單細(xì)胞數(shù)據(jù)整合方法匯總（批次校正）
適用背景 單細(xì)胞數(shù)據(jù)由于實(shí)驗(yàn)平臺或樣本等原因會造成不同數(shù)據(jù)集之間存在批次效應(yīng)涮俄，這種批次效應(yīng)是人為因素造成的，沒有實(shí)際的生物學(xué)意義尸闸，可能對研究結(jié)果...
-
scRNA-Seq | Seurat 打通單細(xì)胞常規(guī)流程Seurat standard pipeline(10核心流程) 創(chuàng)建Seurat對象 Read10X CreateSeuratObjecet質(zhì)...
-
scRNA-Seq | Seurat 包原理解析seurat 涉及的數(shù)據(jù)分析包括很多步驟彻亲。之前只顧著干活兒孕锄，也沒有系統(tǒng)的整理過分析中的具體內(nèi)容。這里就參照網(wǎng)上大神們分享的帖子苞尝，來梳理一下畸肆。 一...