在網(wǎng)上隨意瀏覽的時(shí)候咕宿，無意間發(fā)現(xiàn)另一種可以構(gòu)建調(diào)控網(wǎng)絡(luò)的軟件，叫做GENIE3夯缺。這是一個(gè)R包，直接在R里運(yùn)行甘耿。這款R包基于你的表達(dá)矩陣來推測(cè)基因之間的調(diào)控關(guān)系踊兜。 雖然共表達(dá)網(wǎng)...
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GENIE3——一款預(yù)測(cè)基因調(diào)控網(wǎng)絡(luò)的R包
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SCENIC-轉(zhuǎn)錄因子分析
今天寫一篇關(guān)于單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄因子的分析-scenic在做分析之前你應(yīng)該看一下這篇文獻(xiàn)，看看別人做了什么scenic分析《Single-cell RNA sequencing hi...
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生信筆記4-基因結(jié)構(gòu)與基因組元件名詞解釋順式元件（cis element） Promoter（啟動(dòng)子）：與RNA聚合酶結(jié)合并能起始mRNA合成的序列佳恬。一般認(rèn)為基因上游2 kb-5kb區(qū)域?yàn)樵摶虻膒romoter區(qū)...
