萌哥碎碎念 一直以來都想寫一下下載數據的這些命令和工具仗嗦，現(xiàn)在剛好收集了一些，可以寫一整個專題耀鸦。先分別寫，也許之后還能出一個橫評啸澡。目前規(guī)劃的軟件有： fastq-dl gget...
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原始數據下載專題 | 用fasq-dl下載fastq數據
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優(yōu)化算法應用（二）自動化俄羅斯方塊這是好多年前做過的一個東西奄容，現(xiàn)在用優(yōu)化算法來實現(xiàn)一下。 一． 目標描述 俄羅斯方塊大家應該都玩過产徊。這里的目標是設計一個模型讓電腦計算判斷一個方塊到哪個位置最好昂勒，讓電腦自己控制...
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【文獻速讀】Sequence basis of transcription initiation in human genome
要讀的文章太多了。實在是沒時間把所有的感興趣的文章都精讀一遍舟铜。那就借助GPT快速總結一下文章的內容戈盈。 文章標題：Sequence basis of transcription...
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GitHub 主頁美化設置教程GitHub profile設置教程 早些時候逛GitHub，就發(fā)現(xiàn)別人的主頁特別的精美谆刨，當時沒有空研究塘娶，前幾天得空給安排了一下 先看一下成品 貼一個github上一個男人的...
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【碳匯】不容忽視的森林外樹木碳儲量估算前言 森林外樹木是指生長在森林范圍之外的樹木，如房前屋后的四旁樹痊夭。這些樹木由于分布較為分散且調查難度較大刁岸，其碳儲量估算往往被忽視。然而她我，森林外樹木是城市和鄉(xiāng)村碳庫的重要組成部...
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重生之我在劍橋大學學習單細胞RNA-seq分析——4. 使用Bioconductor進行scRNA-seq分析（1）問題如何將單細胞數據導入 R虹曙？不同類型的數據/信息（例如細胞信息、基因信息等）是如何存儲和操作的番舆？如何獲得細胞和基因的基本匯總指標并相應地過濾數據酝碳？如何直觀地探索這些指標？學...
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【碳匯】區(qū)域尺度（縣恨狈、市）森林植被碳儲量估算前言 單純依賴樣地估測法或機載激光雷達測量方法進行某個縣击敌、市的森林植被碳儲量估算，仍面臨時間過長的問題拴事。在區(qū)域尺度上進行森林植被碳儲量的反演沃斤，許多研究已經開始利用多光譜衛(wèi)星影...
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RoaringBitmap
RoaringBitmap 的實現(xiàn)原理RoaringBitmap 的核心思想是將整數集合劃分為 塊（chunk），并根據每塊的稀疏程度選擇不同的存儲格式刃宵。 分塊（Chunki...
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coitrees 用于管理和查詢區(qū)間數據
使用 coitrees 的方法 構建 COITree 你可以使用 COITree::new 方法來創(chuàng)建一個新的 COITree衡瓶。首先，你需要準備一個包含 Interval 的...
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逛逛第五屆北京生態(tài)食品展 --- 林產品前言 隨著人們對健康生活的重視牲证，生態(tài)食品的需求日益增長哮针，特別是在森林資源豐富的中國，林產品以其獨特的營養(yǎng)價值和生態(tài)優(yōu)勢坦袍，受到了越來越多消費者的青睞十厢。第五屆北京生態(tài)食品展不僅匯...
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NCBI官方真核生物全基因組注釋流程首次開源！嘗鮮體驗踩坑貼奉上~萌哥碎碎念：NCBI的官方注釋流程一直都是出了名的效果拔群準確度極高捂齐，但可惜一直都是非開源的蛮放，看到這么好用的工具卻用不到自己的項目里，心里可太刺撓了奠宜。終于包颁！最近NCBI開源了...
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GEDI_01B數據讀取與森林冠層高度提取前言 對森林高度進行持續(xù)的大尺度監(jiān)測瞻想，對于估算森林碳排放、分析森林退化情況以及量化森林恢復措施的效果具有重要意義娩嚼。星載激光雷達GEDI（Global Ecosystem Dy...
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【林業(yè)應用】基于機載激光雷達單株樹高測算前言 在森林資源調查中蘑险，單株樹的胸徑似乎比樹高更為重要。調查時通常會對每株樹測量胸徑岳悟，但不一定會測量樹高佃迄。這是因為樹高相對較難測量。經驗豐富的林業(yè)調查員通常通過目測估算贵少，或使...
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faSplit 用法
downloadwget https://hgdownload.soe.ucsc.edu/admin/exe/linux.x86_64/faSplit[https://hgd...
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機器學習/深度學習與基因組學資源搜羅
作為一個genomics方向的研究者呵俏，在AI的浪潮中總是避免不了焦慮。擔心被時代拋棄春瞬。 在以前，不識字的我們稱之為文盲套啤；再后來宽气，英語不好是地球村的文盲；接著到了信息時代潜沦，不會...
