生存模型的構(gòu)建方法包括：1. Lasso回歸菊卷；2. Cox多因素回歸集晚；3. 隨機(jī)森林蹭沛；4. 支持向量機(jī) 可以把log_rank_test或cox篩選出的基因單獨(dú)做模型構(gòu)建，也...
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TCGA生存模型的構(gòu)建以及模型預(yù)測和評估 -
TCGA數(shù)據(jù)差異分析后生存分析（批量單因素cox回歸/Lasso篩選，多因素cox建模，時間依賴ROC曲線及KM plot可視化）測序上游分析系列： mRNA-seq轉(zhuǎn)錄組二代測序從raw reads到表達(dá)矩陣：上中游分析pipelinemiRNA-seq小RNA高通量測序pipeline：從raw r...
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R語言獲取 GO/KEGG 中某一通路的基因集
有時候我們想看某一特定通路的富集情況，這時就需要獲取該通路的基因集脐恩。 一、從 GO 中獲取 下載腳本 getGoTerm.R[https://github.com/Jiaha...
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技能帖 | 基因ID和基因名如何快速互換侦讨，三分鐘即可做到
在我們進(jìn)行組學(xué)數(shù)據(jù)分析或者看別人給我們的數(shù)據(jù)報(bào)告的時候驶冒，經(jīng)常會看到諸如ENSG00000141738 之類的名稱，面對這樣的名稱韵卤，我們往往是得不到任何信息的骗污，更不可能把這樣的...
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Nomogram(諾莫圖/列線圖)在R中的實(shí)現(xiàn)本筆記來源于CSDN論壇樓主 anshiquanshu[https://blog.csdn.net/anshiquanshu] 的帖子：R繪制Nomogram圖的學(xué)習(xí)筆記[h...
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R|ifelse、which沈条、%in%的用法
轉(zhuǎn)載自藍(lán)迪的博客:R中ifelse需忿、which、%in%的用法 在R學(xué)習(xí)過程中蜡歹，遇到了ifelse屋厘、which、%in%月而，下面分別舉例汗洒，說明他們的用法。 1父款、ifelse i...
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R語言中的數(shù)據(jù)框
Data Frame一般被譯為數(shù)據(jù)框溢谤，感覺就像是R中的表，由行和列組成憨攒，與Matrix不同的是世杀，每個列可以是不同的數(shù)據(jù)類型，而Matrix是必須相同的肝集。Data Frame每...
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R語言讀寫excel文件2021.2.241玫坛、讀取excel文件 1.1 讀取單個excel文件 直接用read.table()讀取excel文件, 讀取從excel復(fù)制的剪貼板數(shù)據(jù)，再用read.table()讀取...
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終于包晰，我也出了篇R語言入門手冊湿镀！1 什么是R語言R語言是一個開源的數(shù)據(jù)分析環(huán)境，起初是由數(shù)位統(tǒng)計(jì)學(xué)家建立起來伐憾，以更好的進(jìn)行統(tǒng)計(jì)計(jì)算和繪圖勉痴，這篇wiki中包含了一些基本情況的介紹。由于R可以通過安裝擴(kuò)展包（P...
