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  • @小潤澤 是這樣的,我有進行批次效應(yīng)的去除厕九,根據(jù)細(xì)胞來源不同設(shè)置了分組哎壳,現(xiàn)在我想看組間細(xì)胞的差異基因是否可以單獨提取細(xì)胞來做呢

    Seurat中FindMarker尋找兩個cell type差異基因的若干方法

    加載示例數(shù)據(jù) 1.運行Seurat 2.差異分析計算logFC值 其中:對象 cells cells包括兩種cell type的細(xì)胞barcodes(即每一個單獨的細(xì)胞)對象...

  • 請問題主馋嗜,如果我想要比較同一個細(xì)胞類型中不同處理細(xì)胞之前的差異湾笛,我應(yīng)該選擇哪一種方法呢碳胳?例如我想要比較Old_NSC 和 Young_NSC之前的差別烦租。另外我一共有10w細(xì)胞丸冕,我發(fā)向?qū)SC類群單獨提取出來做FindMarkers和在整體Seurat對象中進行FindMarkers分析得到的結(jié)果不同耽梅,請問可能是什么原因呢?

    Seurat中FindMarker尋找兩個cell type差異基因的若干方法

    加載示例數(shù)據(jù) 1.運行Seurat 2.差異分析計算logFC值 其中:對象 cells cells包括兩種cell type的細(xì)胞barcodes(即每一個單獨的細(xì)胞)對象...

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