發(fā)簡信
IP屬地：江蘇
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全過程詳細(xì)步驟解析忘嫉，全部代碼提供媚朦。歡迎交流討論。
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GEO query 下載R
環(huán)境設(shè)置 自定義下載GEO的函數(shù) downGSE <- function(studyID, destdir = destdir) { ##destdir-->之后要存儲(chǔ)數(shù)據(jù)的路徑
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用R獲取芯片探針與基因的對(duì)應(yīng)關(guān)系三部曲
library(Biobase)library(GEOquery) Download GPL file, put it in the current directory, a...
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GPL和對(duì)應(yīng)的symbol轉(zhuǎn)換R包這是生信技能書的更加詳細(xì)的匯總：http://www.reibang.com/p/f6906ba703a0[http://www.reibang.com/p/f6906b...
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sort吠谢、rank、order溪食、arrange排序函數(shù)
R語言中排序有幾個(gè)基本函數(shù)：sort()囊卜、rank()、order()错沃、arrange() sort()函數(shù)是對(duì)向量進(jìn)行從小到大的排序 rank()函數(shù)返回的是對(duì)向量中每個(gè)數(shù)...
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純生信文章結(jié)構(gòu)01~風(fēng)
多線程計(jì)算 查看電腦當(dāng)前核數(shù) 初始化10核心集群 差異分析-mRNA#### 數(shù)據(jù)加載 根據(jù)列名區(qū)分腫瘤組和對(duì)照組 差異分析 edgeR 提取所有差異分析結(jié)果 提取篩選后的結(jié)...
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GSE17708~Jimmy
GEO數(shù)據(jù)的獲日ぷ椤（全文用的是GSE17708這個(gè)數(shù)據(jù)）這里面是芯片數(shù)據(jù)的處理 讀取下載好的文件 生成group_list以便后面使用 保存重要的賦值數(shù)據(jù)生成一個(gè)Rdata： ...
