箋牒九州的怪咖

1唬涧、DAP-seq 在基因組水平上助泽，鑒定轉(zhuǎn)錄因子的結(jié)合位點(diǎn)（transcription factor binding sites, TFBS）非常重要屁柏。ChIP-seq是進(jìn)行...

MYS_bio_man

有人問(wèn)miRNA靶基因如何預(yù)測(cè)的問(wèn)題靡菇，鑒于自己也做過(guò)相關(guān)的分析，稍有點(diǎn)經(jīng)驗(yàn)，總結(jié)記錄一下。 一、miranda預(yù)測(cè) 軟件安裝 測(cè)試example 再舉一例（個(gè)性化分析） mi...

半夜一更

目的 經(jīng)過(guò)fastqc進(jìn)行質(zhì)量控制之后私植，我們能夠發(fā)現(xiàn)在fastq數(shù)據(jù)里存在著一些會(huì)影響下游分析的因素，包括adapter和低質(zhì)量reads等车酣。因此曲稼，在正式進(jìn)入比對(duì)之前，我們要...

ShawnMagic

國(guó)際慣例，先上圖 目的 Overview最后一部分是circRNA染色體分布展示娘摔，這里想到用circos圖就是俗稱的圈圖來(lái)展示窄坦。 關(guān)系: 之前想再circos中把circRN...

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格式 sam文件是短序列比對(duì)生成的文件，是二代測(cè)序中最核心的文件凳寺。在RNAseq鸭津，變異檢測(cè)等分析中，都需要首先生成sam文件格式肠缨。bam文件是sam格式的二進(jìn)制格式逆趋，轉(zhuǎn)換為二...

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2021年開(kāi)年第一篇筆記~ 這篇筆記主要記錄DiffBind包的學(xué)習(xí)晒奕。在很久以前我寫(xiě)過(guò)一篇ATAC-seq分析流程（ATAC-seq分析練習(xí)[https://www.jian...