文章僅是記錄自己的學(xué)習(xí)使用锣笨,有錯(cuò)誤請指出购对,我立刻改正柒瓣! 官方說明https://github.com/tanghaibao/jcvi/wiki/MCscan-(Python-...
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如何使用MUMmer比對大片段序列 測序技術(shù)剛開始發(fā)展的時(shí)候熔恢,大家得到的序列都是單個(gè)基因的長度雷恃,所以一般都是逐個(gè)基因的比較健民,用的都是BLAST或FASTA通過逐個(gè)基因聯(lián)配的方...
作者:童蒙編輯:angelica 前言 序列比對在生物信息中很常見柳恐,通過比較序列的相似度來推測其相關(guān)的功能。序列比對一般針對的是兩條或者多條序列狸捕,可以是DNA惨撇、RNA或者蛋白...
SeqKit的學(xué)習(xí) --20191017 軟件的介紹 SeqKit是一種跨平臺的、極快的府寒,全面的fasta/q處理工具。SeqKit為所有的主流操作系統(tǒng)提供了一種可執(zhí)行的雙元...
一個(gè)rm -r 將自己一暑假的勞動(dòng)成果化為灰燼扎扎扎扎----心瘋狂找彌補(bǔ)措施报腔,但最后都沒有成功株搔,心累 rm 命令一旦使用,灰飛煙滅(我沒成功纯蛾,有解決措施的麻煩教教我) 于是...
聲明:本文部分內(nèi)容和部分圖片來源于網(wǎng)絡(luò)纤房。本文為生信小白學(xué)習(xí)筆記,不能保證專業(yè)名詞和內(nèi)容全部正確或權(quán)威翻诉。 下圖為某一條RNAseq從數(shù)據(jù)預(yù)處理炮姨,序列回帖到數(shù)據(jù)可視化...
linux 環(huán)境下的軟件安裝 wget用到wget命令 wget 剛才復(fù)制的下載鏈接捌刮,如下圖 wget功能wget是一個(gè)下載文件的工具,它用在命令行下舒岸。對于Linux用戶是必...
轉(zhuǎn)錄組分析總流程 數(shù)據(jù)質(zhì)控 背景知識 數(shù)據(jù)量的統(tǒng)計(jì)方式image.png sra轉(zhuǎn)換成fastq 質(zhì)控 image.pngBut what does this quality...