文章僅是記錄自己的學(xué)習(xí)使用锣笨，有錯(cuò)誤請指出购对，我立刻改正柒瓣！ 官方說明https://github.com/tanghaibao/jcvi/wiki/MCscan-(Python-...
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JCVI(MCscan Python version)使用記錄 -
應(yīng)該是最新最詳細(xì)的MUMmer中文使用說明如何使用MUMmer比對大片段序列 測序技術(shù)剛開始發(fā)展的時(shí)候熔恢，大家得到的序列都是單個(gè)基因的長度雷恃，所以一般都是逐個(gè)基因的比較健民，用的都是BLAST或FASTA通過逐個(gè)基因聯(lián)配的方...
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利用Biopython來進(jìn)行序列比對
作者：童蒙編輯：angelica 前言 序列比對在生物信息中很常見柳恐，通過比較序列的相似度來推測其相關(guān)的功能。序列比對一般針對的是兩條或者多條序列狸捕，可以是DNA惨撇、RNA或者蛋白...
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[基因組工具]seqkit的使用
SeqKit的學(xué)習(xí) --20191017 軟件的介紹 SeqKit是一種跨平臺的、極快的府寒，全面的fasta/q處理工具。SeqKit為所有的主流操作系統(tǒng)提供了一種可執(zhí)行的雙元...
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Linux新手小白入門必看技能之給自己準(zhǔn)備個(gè)后悔藥一個(gè)rm -r 將自己一暑假的勞動(dòng)成果化為灰燼扎扎扎扎----心瘋狂找彌補(bǔ)措施报腔，但最后都沒有成功株搔，心累 rm 命令一旦使用，灰飛煙滅（我沒成功纯蛾，有解決措施的麻煩教教我） 于是...
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生信分析學(xué)習(xí)筆記 - RNAseq （二） 雙端測序與單端測序聲明：本文部分內(nèi)容和部分圖片來源于網(wǎng)絡(luò)纤房。本文為生信小白學(xué)習(xí)筆記，不能保證專業(yè)名詞和內(nèi)容全部正確或權(quán)威翻诉。 下圖為某一條RNAseq從數(shù)據(jù)預(yù)處理炮姨，序列回帖到數(shù)據(jù)可視化...
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2020-11-01 day 3 鄭小西學(xué)習(xí)筆記
linux 環(huán)境下的軟件安裝 wget用到wget命令 wget 剛才復(fù)制的下載鏈接捌刮，如下圖 wget功能wget是一個(gè)下載文件的工具，它用在命令行下舒岸。對于Linux用戶是必...
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【轉(zhuǎn)錄組03】報(bào)錯(cuò)分析&數(shù)據(jù)質(zhì)控和過濾轉(zhuǎn)錄組分析總流程 數(shù)據(jù)質(zhì)控 背景知識 數(shù)據(jù)量的統(tǒng)計(jì)方式image.png sra轉(zhuǎn)換成fastq 質(zhì)控 image.pngBut what does this quality...
