不在實(shí)驗(yàn)室克胳，想分析一下流式的數(shù)據(jù)真是困難垒迂，于是乎決定在自己的電腦上安裝一個(gè)破解版的Flowjo大猛。百度嘗試了各種下載版本泼疑，最終發(fā)現(xiàn)了一個(gè)靠譜的下載地址：Flowjo參考的下載地...
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Flowjo軟件安裝 -
轉(zhuǎn)錄組入門（5）： 序列比對(duì)歡迎來GitHub上fork，一起進(jìn)步： https://github.com/xuzhougeng 比對(duì)軟件很多讶隐，首先大家去收集一下抖拦，因?yàn)槲覀兪菐Т蠹胰腴T，請(qǐng)統(tǒng)一用hisa...
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基因組重測序SNP_calling1 介紹 基因組重測序是對(duì)已知基因組序列的物種進(jìn)行不同個(gè)體的基因組測序诫睬，并在此基礎(chǔ)上對(duì)個(gè)體或群體進(jìn)行差異性分析煞茫。 基于全基因組重測序技術(shù)，人們期望快速進(jìn)行資源普查篩選摄凡，尋找到...
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基于R語言繪制坐標(biāo)軸截?cái)鄨D畫圖時(shí)經(jīng)常遇到不同組的數(shù)據(jù)大小相差很大续徽，大數(shù)據(jù)就會(huì)掩蓋小數(shù)據(jù)的變化規(guī)律，這時(shí)候可以對(duì)Y軸進(jìn)行截?cái)嗲自瑁瑥亩梢栽诓煌瑢用妫ù髷?shù)據(jù)和小數(shù)據(jù)層面）全面反映數(shù)據(jù)變化情況钦扭，如下圖所示。 ...
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寶藏R包：TCGA的轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)挖掘一站搞定
最近在看ceRNA的時(shí)候看到了一個(gè)寶藏R包床绪，寫包簡化了芯片數(shù)據(jù)下游分析之后客情，我正想著寫轉(zhuǎn)錄組下游分析的簡化版，就看到了它会涎。用起來~ 0.R包和數(shù)據(jù)準(zhǔn)備 這里使用的是作者給的示...
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二代數(shù)據(jù)鑒定ncRNA軟件原理與應(yīng)用二代數(shù)據(jù)鑒定ncRNA常用軟件 目前裹匙，對(duì)于二代數(shù)據(jù)分析lncRNA的流程大致為： 目前有很多軟件可以鑒定樣本中的ncRNA，但是每一個(gè)軟件的都會(huì)有一定的假陽性末秃，所以最好是多個(gè)...
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KEGG概页、GO富集分析與GSEA并不是二選一最廣為人知的富集分析做法是把上調(diào)、下調(diào)基因分別或者合并练慕，拿來做GO和KEGG富集分析惰匙。經(jīng)常有一些數(shù)據(jù)集，拿差異基因做得不到結(jié)果铃将，那是因?yàn)榇_實(shí)富集不到任何通路项鬼，是正常的。不妨試...
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enrichplot||基因富集結(jié)果可視化解決方案enrichplot包實(shí)現(xiàn)了幾種可視化方法來幫助解釋富集結(jié)果劲阎。它支持從DOSE (Yu et al. 2015)绘盟、clusterProfiler (Yu et al. 201...
