首先打開R交互式命令行，利用which R查看當前R的位置彤避，確認丁屎。之后在R中執(zhí)行以下兩行代碼： 之后刷新jupyter lab踱稍，就能看到有一個R kernel出現(xiàn)了枷恕。 參考：...
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如何在jupyter lab中添加R kernel
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Jupyter Notebook 快捷鍵 （針對Mac電腦）
快捷鍵可以在Jupyter Notebook的頂部Help > Keyboard Shortcuts查看固棚。下面整理的是一些我自己常用的快捷鍵都弹。 與vim類似，Jupyter ...
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Matplotlib官方文檔 1 - A Simple Example對matplotlib的官方文檔做一個簡單的總結方便查閱锣杂。來源：https://matplotlib.org/stable/tutorials/introductory/us...
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利用Seaborn畫Heatmap/Clustermap
參數(shù)介紹：data：矩形數(shù)據(jù)集vmax脂倦，vmin：用于決定色彩映射的值cmap：matplotlib顏色條名稱或者對象，或者顏色列表center：用于決定色彩映射元莫，繪制有色數(shù)...
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最大互信息系數(shù)（MIC）與minepy的使用
Minepy與MIC簡介 minepy是基于最大互信息的非參數(shù)勘探（MINE赖阻，Maximal Information-based Nonparametric Explorat...
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Pandas DataFrame篩選包含某個關鍵詞的行/列
首先把需要篩選的列轉化為pandas.core.strings.StringMethods,然后再用contains函數(shù)來得到布爾值的 （因為直接取行/列為Series對象，...
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linux下rename用法
rename可以用來批量重命名霎俩。The rename command is part of the util-linux package and is avail...
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安裝package遇到的問題
Error in if (nzchar(SHLIB_LIBADD)) SHLIB_LIBADD else character() :argument is of length...
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查看R的各種工作路徑
R的主目錄（設置的文件與安裝文件的放置）：Sys.getenv("R_HOME")Sys.putenv()Sys.setenv() R的library的搜尋目錄（安裝包所在的...
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Anaconda介紹柳击、安裝及使用教程〇猿推、序 Python是一種面向對象的解釋型計算機程序設計語言，其使用捌肴，具有跨平臺的特點蹬叭，可以在Linux、macOS以及Windows系統(tǒng)中搭建環(huán)境并使用状知，其編寫的代碼在不同...
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Linux shell 提取文件名
很多時候在使用Linux的shell時秽五，我們都需要對文件名或目錄名進行處理，通常的操作是由路徑中提取出文件名饥悴，從路徑中提取出目錄名坦喘，提取文件后綴名等等。例如铺坞，從路徑/dir1...
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我們如何不通過比較兩個文件起宽，單靠一個文件檢查每個特定TF的染色質可接近性呢？
使用HINT-ATAC進行ATAC-Seq的footprinting分析
關于ATAC-seq分析济榨，在網(wǎng)上看到兩篇關于同一片綜述的翻譯坯沪，寫的很好：ATAC-seq數(shù)據(jù)分析工具的比較和推薦（Genome Biology綜述）ATAC-seq生信分析綜...
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Pyenv管理環(huán)境(附conda)
查看可安裝版本：pyenv install --list 篩選可安裝版本：pyenv install --list | grep 3.6 安裝命令：pyenv install...
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git clone無法鏈接github網(wǎng)頁
比如：git clone http://github.com/GreenleafLab/ArchR.git改成：git clone git://github.com/Gree...
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提高git clone的速度
vi ~/.gitconfig添加[http]proxy = socks5://127.0.0.1:1080[https]proxy = socks5://127.0.0.1...
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向量化計算和*apply家族
向量化計算 *apply家族: 在指定維度上進行運算-apply-lapply, sapply-mapply, tapply MARGIN=1 為行MARGIN=2 為列高維...
