寫在前面 DOI: 10.1002/advs.202403095 今天分享的文獻發(fā)表在《advanced science》上有滑，影響因子為14.3启搂，題目是“****Sexual...
IP屬地：江蘇
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IF14.3| scRNA-seq+脂質(zhì)組多組學分析揭示宮內(nèi)生長受限導致肝損傷的性別差異 -
可變剪切分析神器——rMATs一辆脸、寫在前面 選擇性剪接（Alternative splicing，AS）是剪除未成熟mRNA中的內(nèi)含子、保留外顯子后生成成熟mRNA的過程。在各類疾病發(fā)生和發(fā)展過程中，異常...
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R語言基礎(chǔ)| 機器學習寫在前面 R語言中基礎(chǔ)的機器學習主要有：分類澄步、聚類、降維和泌、回歸(預(yù)測村缸，自變量和因變量)這積累問題。拿到數(shù)據(jù)和問題首先要會判定是這4類中的哪一種武氓。 此前我們也用專門的教程介紹過...
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如何在R語言中調(diào)用Python寫在前面 其實大家在Rstudio中像下圖這樣直接創(chuàng)建Python腳本后梯皿，Rstudio便可以把代碼直接交給Python命令解釋器來處理。 或者說县恕，大家也可以在寫Rmarkd...
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想了很久的生信基地生信基地 回想四年前东羹，自學生信倍感痛苦的我由己及人，毅然決然下場開始做生信教程忠烛。面對平臺現(xiàn)有的流量属提、致謝我的文章[https://mp.weixin.qq.com/mp/ap...
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Linux也有百度云喔~一、寫在前面 經(jīng)常有粉絲向我抱怨，為什么每次發(fā)放資料都用百度云冤议，自己下載了一遍之后還得再上傳一遍服務(wù)器才能分析斟薇。其實大家大可不必這么周轉(zhuǎn)，百度云也有Linux的發(fā)行版本恕酸，利用...
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快速上手CellrangerCell Ranger Cell Ranger是用于10x單細胞轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)處理一套Linux工具集堪滨，包含數(shù)據(jù)比對，生成表達矩陣尸疆，聚類分析和圖形可視化等多個功能椿猎。一般用cell...
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Tangram利用深度學習完成空間與單細胞數(shù)據(jù)的整合一惶岭、寫在前面 單細胞(single-cell)與單細胞核(single-nucleus)測序已經(jīng)為許多物種寿弱、組織、器官提供了全面的細胞圖譜按灶，能夠幫助我們了解細胞類型症革、表達特征...
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應(yīng)審稿人要求| pseudo bulk差異分析一、寫在前面 最近有粉絲提問鸯旁，收到了如下的審稿人意見： 審稿人認為在單細胞測序過程中噪矛，利用findMarker通過Wilcox獲得的差異基因雖然考慮到了不同組別細胞數(shù)量的不同...
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進程介紹01、寫在前面 在計算機科學中铺罢，進程（Process）是指正在運行的程序的實例艇挨。它是計算機系統(tǒng)中一個具有獨立執(zhí)行流的單元，它包含了程序代碼韭赘、數(shù)據(jù)以及程序運行所需的系統(tǒng)資源缩滨。簡...
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jupyter如何切換內(nèi)核
01、寫在前面 Jupyter是一個開源的交互式筆記本工具泉瞻，支持多種編程語言脉漏，包括Python、R袖牙、Julia 等侧巨。它最初是作為IPython 筆記本的一個分支而開發(fā)的，后來...
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碼Python神器：jupyter notebook寫在前面 上一次內(nèi)容我們介紹了Pycharm的安裝與配置過程(Python的"Rstudio"——Pycharm[http://mp.weixin.qq.com/s?__bi...
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一文了解并掌握samtools一鞭达、寫在前面 隨著高通量測序技術(shù)的發(fā)展司忱，新的數(shù)據(jù)格式為數(shù)據(jù)交互性、緊湊存儲和高效數(shù)據(jù)分析提供了必要條件(畢竟買硬盤要花實打?qū)嵉你y子)畴蹭。而目前最常用的SAM文件和VCF文件是由...