寫在前面 我受夠了渴语!整天有人問(wèn),TBtools怎么畫這個(gè)圖 但是我其實(shí)只想回一句: 你畫這個(gè)圖干什么昆咽?有什么意義驾凶?你想說(shuō)談什么生物學(xué)故事牙甫? 承認(rèn)吧,你什么都不知道调违,什么都沒(méi)搞...
![240](https://cdn2.jianshu.io/assets/default_avatar/15-a7ac401939dd4df837e3bbf82abaa2a8.jpg?imageMogr2/auto-orient/strip|imageView2/1/w/240/h/240)
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本文參考 生信札記[http://www.reibang.com/u/068665394ccf] 相關(guān)內(nèi)容制作 準(zhǔn)備數(shù)據(jù): 1.物種內(nèi)的共線性分析 2.已經(jīng)鑒定好的基因家族...
寫在前面 在很久很久以前且轨,由于課題的需要,我寫了一個(gè)Circos圖繪制功能(在TBtools里《任何人虚婿!十分鐘掌握Circos圖繪制》)....從那以后旋奢,我就再也沒(méi)用過(guò)。這是...
一:準(zhǔn)備文件 1.染色體長(zhǎng)度文件 偷懶直接打開(kāi)gff文件然痊,前幾行就是染色體信息至朗,粘貼出來(lái)就好,保存為chr_length.txt 2.Text文件 在圖片中顯示的gene名字...
更多內(nèi)容關(guān)注微信公眾號(hào):“今日之森” 后獲取剧浸。 “好看的皮囊千篇一律锹引,有趣的靈魂萬(wàn)里挑一” 進(jìn)化樹的構(gòu)建絕不僅僅是將一堆序列扔進(jìn)MEGA等建樹軟件,隨便生成樹那么簡(jiǎn)單辛蚊,因?yàn)榭?..
寫在前面 半個(gè)月前粤蝎,我推了一個(gè)《任何人都能掌握-基因家族分析》的騰訊課程(原本事實(shí)是開(kāi)給課題組)。在熱身課程(完全免費(fèi))中袋马,將我個(gè)人對(duì)基因家族分析的認(rèn)知和其意義均做了說(shuō)明初澎,感...
寫在前面 年初在汕頭婚宴上,我問(wèn)一個(gè)朋友虑凛,現(xiàn)在在做什么工作碑宴。他回復(fù)了我: 但行好事,莫問(wèn)前程桑谍。 現(xiàn)在看來(lái)延柠,挺好。 構(gòu)建進(jìn)化樹的基礎(chǔ)是序列對(duì)齊锣披,或者說(shuō)多序列比對(duì)贞间。做序列對(duì)齊的主...
報(bào)錯(cuò)原因:輸入的alignment軟件中有序列間沒(méi)有等位位點(diǎn),導(dǎo)致遺傳距離有缺失值,無(wú)法計(jì)算遺傳距離雹仿。 解決辦法:刪除相互之間沒(méi)有共同等位位點(diǎn)的序列增热,重新導(dǎo)入mega中即可。
前面推文所提基本性質(zhì)的分析(理化性質(zhì)邑商,基因染色體分布摄咆,基因結(jié)構(gòu)凡蚜、基序和保守結(jié)構(gòu)域)已完成,進(jìn)一步基因家族成員的進(jìn)化分析可以推測(cè)未知基因的功能吭从,也會(huì)讓文章更為完整朝蜘。進(jìn)化分析包括...