走到了最后一步纷闺,去哪找log后的文件啊
判斷GEO芯片數(shù)據(jù)表達(dá)矩陣是否需要log2轉(zhuǎn)換通過exprs函數(shù)獲取表達(dá)矩陣后我們可以通過以下三種方法判斷是否需要進(jìn)行l(wèi)og2轉(zhuǎn)換 1.肉眼識別 最簡單粗暴的方法就是算凿,根據(jù)數(shù)值大小粗略估計(jì):如果表達(dá)量的數(shù)值在50以內(nèi),通...
我只有疾病組跟control組裆熙,stringr應(yīng)該不能用吧端礼,有沒有可替換的包啊入录?謝謝蛤奥!
12.GEO數(shù)據(jù)集的R語言差異分析和代碼解析—1.數(shù)據(jù)下載和整理一、舉例介紹 本節(jié)下載GSE1009數(shù)據(jù)集僚稿,使用limma包進(jìn)行差異分析舉例凡桥。 GSE1009 樣本量:共6個(gè)樣本,其中3個(gè)為糖尿病腎病(DN)腎小球樣本蚀同,另3個(gè)為正常腎小球...
同學(xué)您好,我做的圖XY軸同案例二髓霞,并且X軸數(shù)值2000 4000 6000卦睹,我是不是調(diào)成圖一的樣子,換換XY軸就行了酸茴,謝謝分预!
一文看懂火山圖一文看懂火山圖 火山圖可用于展示兩組樣本間基因表達(dá)水平差異的分布狀況。 橫軸log2 fold change差異表達(dá)倍數(shù)(Fold Change值薪捍,簡稱FC笼痹,根據(jù)log2 f...