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  • 為什么您assoc后,有A2呢版确?

    GWAS分析-說人話(9)初嘗關(guān)聯(lián)分析禁果

    前言 OK乎折,這里只是初嘗關(guān)聯(lián)分析绒疗,有很多參數(shù)上的設(shè)置,及說明 請(qǐng)參考其他文章(有空會(huì)在最下面補(bǔ)上)骂澄。 書接上一回(GWAS分析-說人話(4)合并數(shù)據(jù))吓蘑,當(dāng)我們整理好了一個(gè)合并...

  • 可怕,我居然連寫2篇隨筆脐嫂。(我的OTU和ASV還靜靜躺在草稿里)

  • 寫了一半從實(shí)驗(yàn)室回家了 后半段似乎不夠一氣呵成统刮。
    不過,不影響中心主旨账千。哈哈哈??

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    我想做個(gè)理想主義者

    昨天(6.17)是一年一度的生日侥蒙。一如既往,要進(jìn)行一番自我思考蕊爵、自我剖析辉哥。 緣分妙不可言 本科畢業(yè)4年,碩士畢業(yè)1年攒射,9月即將正式入學(xué)讀生物博士醋旦。8年前,高考結(jié)束的那一刻会放,我...

  • 您好矢沿,想問一下滥搭,我在vcf轉(zhuǎn)換成map,ped文件時(shí)候,報(bào)錯(cuò)捣鲸,line 23969 of .vcf file has fewer tokens than expected瑟匆, 您遇到過嗎,2號(hào)染色體栽惶,轉(zhuǎn)不下去了

    基因型數(shù)據(jù)與1000G merge后做PCA看人群分布

    寫在前面愁溜,對(duì)于生信新手來說,不熟悉代碼的基礎(chǔ)外厂,總是空中樓閣一般冕象,想搜一條代碼、做一些適合自己數(shù)據(jù)的運(yùn)算更是難上加難汁蝶,踩過的坑總要填渐扮,為了新手們不要像我一樣浪費(fèi)時(shí)間在這苦惱的代...

  • 基因型數(shù)據(jù)與1000G merge后做PCA看人群分布

    寫在前面,對(duì)于生信新手來說,不熟悉代碼的基礎(chǔ)墓律,總是空中樓閣一般意荤,想搜一條代碼、做一些適合自己數(shù)據(jù)的運(yùn)算更是難上加難只锻,踩過的坑總要填,為了新手們不要像我一樣浪費(fèi)時(shí)間在這苦惱的代...

  • 自建圖書館

    很久沒有寫東西更新這個(gè)生活相關(guān)的標(biāo)簽了笤昨。目前在挪威生活了快半年祖驱,學(xué)習(xí)了挪威語,工作上也接觸了新的領(lǐng)域瞒窒。另外希望自己仍然保持日常讀書的習(xí)慣捺僻。但是我慢慢發(fā)現(xiàn),很多書崇裁,我讀過了匕坯,記...

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    UKBB數(shù)據(jù)集下載流程(第二節(jié))

    很久沒有更新,被老板抓走做別的去了拔稳。 主要數(shù)據(jù)集下載 閱讀使用手冊(cè)上葛峻,會(huì)有一些field,bulk, individuals這樣的詞巴比,比較難以對(duì)應(yīng)網(wǎng)站上的標(biāo)簽术奖。下面我來講解一...

  • 我沒有用過網(wǎng)頁版的,是不是國內(nèi)不能扒峤省采记?

    TwoSampleMR 遇到的坑

    第一次嘗試醫(yī)學(xué)統(tǒng)計(jì)常用的MR,我選擇了比較多用的R包政勃,TwoSampleMR, 這個(gè)包還有一個(gè)webApp -- MRbase.所有流程基本和網(wǎng)上可以搜到的一樣唧龄,這里推薦這個(gè)...

  • 想問下作者,GUI生成的熱圖什么的怎么保存呢稼病?

    02—甲基化芯片的一般分析流程

    什么是甲基化芯片选侨?一文了解 MethylationEPIC 850K 甲基化芯片 簡而言之,是基于亞硫酸鹽處理后的DNA序列雜交的信號(hào)探測(cè)然走。亞硫酸鹽是甲基化探測(cè)的:金標(biāo)準(zhǔn)“援制,...

  • 您好,想問一下您用這個(gè)跑過EPIC的數(shù)據(jù)嗎

    ChAMP包學(xué)習(xí)(4)

    9. Gene Set Enrichment Analysis 基因集富集分析是生物信息學(xué)研究的重要環(huán)節(jié)芍瑞。在前面的步驟之后晨仑,已經(jīng)獲得了一些重要的DMPs或DMRs,因此我們可...

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    ChAMP包學(xué)習(xí)(4)

    9. Gene Set Enrichment Analysis 基因集富集分析是生物信息學(xué)研究的重要環(huán)節(jié)。在前面的步驟之后洪己,已經(jīng)獲得了一些重要的DMPs或DMRs妥凳,因此我們可...

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    GWAS imputation

    GWAS imputation是什么逝钥? Genotype imputation 是運(yùn)用連鎖不平衡的原理依據(jù)一個(gè)高密度的參考基因組填補(bǔ)要研究數(shù)據(jù)的一種方法。 常用的參考基因組數(shù)...

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