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等位基因特異性表達(dá)(ASE)及順反式調(diào)控研究的相關(guān)分析整理
在對動植物雜交種（或F1子代）的基因組和轉(zhuǎn)錄組的關(guān)聯(lián)研究中，要回答這么一個問題：基因組變異到底與基因表達(dá)有什么關(guān)系钱床？ 這個問題很難荚斯，因?yàn)樯婕坝绊懟虮磉_(dá)調(diào)控的因素可太多了！多...
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基因組裝 | hifiasm 輸出結(jié)果文件細(xì)究基因組組裝這塊我看的不是很多查牌，盡管也看過一些資料事期，跟朋友也討論過。但仍然感覺理解不夠深入纸颜。索性兽泣，自己直接肉眼看看，或許更為實(shí)在胁孙。 hifiasm 輸出結(jié)果有哪些唠倦？ 一般來說，...
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跟著Nature Communications學(xué)作圖：R語言circlize包做漂亮的弦圖論文 A latitudinal gradient of deep-sea invasions for marine fishes https://www.nature.co...
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跟著Nature Communications學(xué)數(shù)據(jù)分析：基因組水平的比對鑒定結(jié)構(gòu)變異論文 Pan-genome inversion index reveals evolutionary insights into the subpopulation stru...
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公號“生物育種數(shù)據(jù)分析”作者候齿，歡迎關(guān)注！日常分析生物數(shù)據(jù)分析筆記、經(jīng)驗(yàn)和小技巧慌盯。
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使用MapMan分析水稻基因功能
MapMan是老牌的植物基因功能分析工具周霉，早期是針對基因芯片數(shù)據(jù)設(shè)計(jì)，現(xiàn)在可以用于各種模式植物或非模式植物基因集的功能分析亚皂，并且該軟件一直保持著更新俱箱。 完成MapMan分析，...
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植物代謝通路注釋+基因表達(dá)可視化神器--Mapman植物代謝通路注釋+基因表達(dá)可視化神器--Mapman 關(guān)鍵詞： 植物 代謝通路 基因表達(dá) Mapman 你可以對基因進(jìn)行功能注釋芋簿，分析其功能分類以及相關(guān)的通路信息，你也能分析...
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【第 0 章 緒論】作物育種學(xué)總結(jié)筆記
作物生產(chǎn)改良途徑：作物遺傳改良璃饱、作物生長條件改善 第一節(jié) 作物進(jìn)化與遺傳改良 一与斤、作物品種的概念 1. 品種（variety/cultivar）：人類在一定生態(tài)條件和經(jīng)濟(jì)條件...
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KASP標(biāo)記與農(nóng)作物育種KASP的特點(diǎn) 在過去30 年中，分子標(biāo)記從低通量限制性片段長度多態(tài)性（RFLP）開始荚恶，到最近達(dá)到的基于NGS 技術(shù)的SNP 標(biāo)記撩穿，已經(jīng)經(jīng)歷了三代。競爭性等位基因特異性PCR...
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SSRminer | 微衛(wèi)星分子標(biāo)記開發(fā)谒撼，我64秒搞定~寫在前面 如果說在濕實(shí)驗(yàn)的主要研究方向上食寡，我還有沒太接觸的，那么就是“跑大版膠”廓潜，開發(fā)分子標(biāo)記抵皱。于是，這一塊相關(guān)功能辩蛋，我并沒有太多想法開發(fā)呻畸。只是最近開始接觸一些群體遺傳相關(guān)教...
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個人博客: xuzhougeng.top (隨緣訪問)
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如何對SNP設(shè)計(jì)引物: CAPS, dCAPS最近一直在幫師姐根據(jù)SNP找基因組上的酶切多態(tài)位點(diǎn)，然后給她提供該位點(diǎn)附近1kb的序列花枫，讓她去設(shè)計(jì)引物澄耍。由于我本科就做過一點(diǎn)點(diǎn)的遺傳定位昔逗，當(dāng)時用的是SSCP(單分子構(gòu)象多態(tài)性...
