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保存好的hnsw索引圖在下次使用時要如何載入呢热押？

HNSW原理

前言 HNSW用于近似最近鄰搜索苛吱，下面將首先講解HSNW的構(gòu)建原理刚陡，為了方便讀者閱讀HNSW源碼陆盘，避免被HNSW繁雜的參數(shù)弄的暈頭轉(zhuǎn)向舷蟀，我還附上了HSNW索引的內(nèi)存模型圖恤磷，圖...

MartinNum

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@765bcfa34968 nanopore測序的GEO數(shù)據(jù)集里包含SRA數(shù)據(jù)，在SRA數(shù)據(jù)底下會給鏈接的野宜。

用python把多個文件夾的nanopore測序結(jié)果文件合并到同一個文件夾

從ncbi下載的fast5格式nanopore測序原始數(shù)據(jù)解壓后分裝在多個文件夾里扫步。在需要對其進行整體處理時操作十分不便。利用python寫幾行代碼可以輕松把多個文件夾內(nèi)的文...

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從ncbi下載的fast5格式nanopore測序原始數(shù)據(jù)解壓后分裝在多個文件夾里匈子。在需要對其進行整體處理時操作十分不便河胎。利用python寫幾行代碼可以輕松把多個文件夾內(nèi)的文...

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您好，我想問用Guppy進行basecall后生成的fast5文件里的move和trace數(shù)據(jù)是什么意思虎敦？謝謝

Nanopore測序及數(shù)據(jù)處理

一游岳、工作原理 新型納米孔測序法（nanopore sequencing）；采用電泳技術(shù)其徙。 Nanopore測序當(dāng)中的核心部件是這個由蛋白質(zhì)構(gòu)成的納米級的小孔吭历，我...

九月_1012

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第一步報錯，無法定位軟件包1sb-release擂橘，求助

利用guppy進行basecalling

目前晌区，絕大部分的生物信息分析是從原始測序的fastq格式文件開始的。而nanopore可以保存為fast5格式通贞，MinKNOW軟件是可以直接進行basecalling輸出fa...

莫讠

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weixin訂閱：扒蒜小妹的日常 scATAC分析資料：scATAC分析資料[http://www.reibang.com/p/e78ed34e71e5]scATAC-se...

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請教一下Tombo和做basecall的軟件功能上有什么不同呢朗若？謝謝

Nanopore數(shù)據(jù)分析軟件tomobo

Nanopore數(shù)據(jù)分析軟件tomobo Tombo is a suite of tools primarily for the identification of modi...

科研菜鳥

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@科研菜鳥 就是如果我是體外轉(zhuǎn)錄了一段2000多bp的序列茎用，用DRS測序了遣总，現(xiàn)在想得到測序出來的reads每個堿基對應(yīng)的dwell time和signal intensity睬罗。tombo可以用這個2000多的序列做reference然后re-squiggle嗎？具體要怎樣做呢旭斥？謝謝你容达！

Nanopore 數(shù)據(jù)分析軟件tombo （二）

NOTE:所有Tombo命令也可用于DRS reads，但必須為剪切的轉(zhuǎn)錄本提供轉(zhuǎn)錄組參考序列垂券。 運行tombo-h查看所有tombo命令花盐，運行tombo [command ...

科研菜鳥

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tombo的reference可以是任意一段已知序列而非某物種的基因組或轉(zhuǎn)錄本組嗎？

Nanopore 數(shù)據(jù)分析軟件tombo （二）

NOTE:所有Tombo命令也可用于DRS reads菇爪，但必須為剪切的轉(zhuǎn)錄本提供轉(zhuǎn)錄組參考序列算芯。 運行tombo-h查看所有tombo命令，運行tombo [command ...

科研菜鳥

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