第一步:下載二進制安裝包 第二步: 第三步上傳數(shù)據(jù): 第四步下載數(shù)據(jù):
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第一步:安裝 第二步:掛載目錄并使用測試數(shù)據(jù) 注意:需要提前下載好interproscan和pfam數(shù)據(jù)庫。需要預(yù)測抗性基因的蛋白文件存放到個人目錄/40t_2/docker...
輸入文件(包含測序材料號的文件,測序材料后綴需要是_1.fq.ft.gz,_2.fq.ft.gz ) 使用的perl腳本如下: 輸出結(jié)果(材料對應(yīng)的左端和右端reads長度):
1. 用于展示大白菜和其他群體相似度、 輸入文件:nearest.bins.lst.matrix 輸入文件:sorted.groups.lst.added 結(jié)果圖:
介紹:利用ggplot2繪制barplot腳本:barplot.r 輸入文件(Count.of.group.combinations.lst)格式: 結(jié)果圖
介紹:利用ggplot2做dotplot選擇信號展示 腳本為: plot_singles_Zscore.r 文件格式: 結(jié)果圖:
先配置Windows系統(tǒng)主機的共享文件夾 控制面板 程序和功能 啟動或關(guān)閉window功能 打開 SMB 1.0/CIFS 服務(wù)和客戶端 Linux中操作如下:sudo ...
介紹:使用基因區(qū)域的SNP诉瓦,繪制不同群體中基因的haplotypes 輸入文件格式: 腳本:plot_haplotypes.pl 結(jié)果圖展示