前面已經(jīng)簡(jiǎn)單介紹過(guò)GWAS的概念,GWAS分析中所用到的文件以及分析流程算墨,我們?cè)贕WAS分析結(jié)果文件中經(jīng)常會(huì)看到beta值和P值口注,他們分別代表什么意思夺饲?這兩個(gè)值又有什么關(guān)系呢...
![240](https://upload.jianshu.io/users/upload_avatars/20190077/533993f7-2e9d-48a1-bc91-51a10ceda40a.jpg?imageMogr2/auto-orient/strip|imageView2/1/w/240/h/240)
前面已經(jīng)簡(jiǎn)單介紹過(guò)GWAS的概念,GWAS分析中所用到的文件以及分析流程算墨,我們?cè)贕WAS分析結(jié)果文件中經(jīng)常會(huì)看到beta值和P值口注,他們分別代表什么意思夺饲?這兩個(gè)值又有什么關(guān)系呢...
IntAssoplot包可以將GWAS結(jié)果和LD拆挥, 基因結(jié)構(gòu)圖整合在一起畫出屯吊。介紹來(lái)自:https://github.com/whweve/IntAssoPlot[https...
@[toc] 0.1 introduction介紹 高通量技術(shù)導(dǎo)致數(shù)據(jù)維度以及樣本數(shù)量呈指數(shù)增長(zhǎng)楞陷,使得對(duì)數(shù)據(jù)集進(jìn)行手動(dòng)處理顯得不太實(shí)際怔鳖。但是由于收集數(shù)據(jù)的技術(shù)不完善或者數(shù)據(jù)本...
在初步特征篩選之后,若使用樹(shù)模型固蛾,特征經(jīng)過(guò)數(shù)值化處理后就可以模型進(jìn)行效果評(píng)估结执,一般會(huì)給出一個(gè)AUC或KS的模型評(píng)估結(jié)果。這里假設(shè)我們放入的特征數(shù)量為N艾凯,我期盼的是通過(guò)丟棄某些...
一献幔、何為GWAS? GWAS(Genome-wide Association Study)是對(duì)多個(gè)個(gè)體在全基因組范圍的遺傳變異(標(biāo)記)多態(tài)性進(jìn)行檢測(cè)趾诗,獲得基因型蜡感,進(jìn)而將基因型...
概覽 Title:From GWAS to Function: Using Functional Genomics to Identify the Mechanisms Un...
今天我們來(lái)看一個(gè)非常常見(jiàn)和使用的無(wú)監(jiān)督機(jī)器學(xué)習(xí)算法——K-均值聚類(K-means) 首先我們先了解一下這個(gè)算法的大致背景: 首先要知道什么是聚類 聚是一個(gè)將數(shù)據(jù)集中在某些方...
首先介紹三種類型的聚類方法: 原型聚類:假設(shè)聚類結(jié)構(gòu)能夠通過(guò)一組原型求解。通常算法先對(duì)原型進(jìn)行初始化律胀,然后進(jìn)行迭代求解贝乎。不同的原型表示情连、不同的迭代求解方式,將會(huì)產(chǎn)生不同的原型...