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對(duì)于非模式和一般的分析來(lái)說(shuō),phasing沒(méi)啥用务蝠。我沒(méi)有碰到過(guò).|.的vcftools報(bào)錯(cuò)诅需,不知道你是哪個(gè)版本的信殊。
GATK HaplotypeCallerSpark模塊的使用GATK的HaplotypeCaller是經(jīng)常用到的變異檢測(cè)模塊,但在大基因組或高深度測(cè)序模式下運(yùn)行速度比較慢伞广,雖然有--native-pair-hmm-threads多線程...
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幫別人解決的嚼锄,順便記錄了下
SMC++ 安裝SMC++ 是分析種群歷史的一個(gè)軟件减拭,主要用在重測(cè)序數(shù)據(jù)分析中。 git地址 GitHub - popgenmethods/smcpp: SMC++ infers popul...
請(qǐng)問(wèn) kegg_all_clean.fa 這些文件是從哪里下載到的啊?
【數(shù)據(jù)庫(kù)】本地KEGG數(shù)據(jù)庫(kù)如何拆分子庫(kù)灾票?根據(jù)相似性原理峡谊,序列相似,功能相似刊苍,所有功能注釋無(wú)非是用比對(duì)工具將輸入序列比對(duì)到數(shù)據(jù)庫(kù)序列既们,再將輸入ID對(duì)應(yīng)數(shù)據(jù)庫(kù)ID,進(jìn)一步對(duì)應(yīng)到功能條目的關(guān)系正什。 數(shù)據(jù)庫(kù)要么建到本地啥纸,要么...
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1.InterPro注釋 InterPro數(shù)據(jù)庫(kù)簡(jiǎn)介 Interpro是EBI開(kāi)發(fā)的一個(gè)整合的蛋白家族功能注釋數(shù)據(jù)庫(kù)斯棒,包括Gene3D、CDD主经、Pfam等10幾個(gè)數(shù)據(jù)庫(kù)荣暮,官網(wǎng)...
您好,我想問(wèn)下 rap Os01g0100100 g后面的7位數(shù)字代表什么罩驻,msu后面的5位數(shù)字又是代表什么
粳稻參考基因組ID轉(zhuǎn)換粳稻參考基因組日本晴主要常用的有兩個(gè)版本穗酥,分別為The Rice Annotation Project (RAP)(https://rapdb.dna.affrc.go.jp...