每個(gè)基因的外顯子起始與結(jié)束的位置趟庄，保存為1.txt,注意需要打開1.txt編輯刪除第一行的空行 計(jì)算每個(gè)外顯子的大小 計(jì)算每個(gè)內(nèi)含子的大小 統(tǒng)計(jì)每個(gè)基因外顯子的數(shù)量
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根據(jù)GFF3文件統(tǒng)計(jì)外顯子大小和數(shù)量以及內(nèi)含子大小
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Batch SMART 最強(qiáng)序列特征[結(jié)構(gòu)域]預(yù)測軟件寫在前面 前天戚啥，在學(xué)位論文的完善中，有兩個(gè)疑似ERF成員始終令我困擾锉试。植物轉(zhuǎn)錄因子中有個(gè)超家族AP2猫十，包括兩個(gè)亞家族，一個(gè)也叫AP2呆盖，另一個(gè)叫ERF。前者往往含有兩個(gè)AP2結(jié)...
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TBtools | 保守 Motifs 到底屬于哪個(gè)結(jié)構(gòu)域寫在前面 TBtools 基本涵蓋了基因家族分析所常見的所有分析與可視化功能应又，其中最為獨(dú)特的 莫過于 Gene Structure View (Advanced) 幾乎覆蓋了...
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基因組共線性工具M(jìn)CScanX使用說明MCScanX是檢測基因共線性和進(jìn)化分析的常用工具之一，2012發(fā)表至今引用數(shù)200+株扛，作者之一的唐海寶老師是國內(nèi)植物基因組學(xué)生信分析尤筐、軟件開發(fā)領(lǐng)域的大拿，在學(xué)習(xí)使用MCSc...
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轉(zhuǎn)錄組入門（7）：差異表達(dá)分析這個(gè)步驟推薦在R里面做，載入表達(dá)矩陣倾贰，然后設(shè)置好分組信息秕狰，統(tǒng)一用DEseq2進(jìn)行差異分析，當(dāng)然也可以走走edgeR或者limma的voom流程躁染∶В基本任務(wù)是得到差異分析結(jié)果吞彤，進(jìn)...
