概述 本教程演示了如何使用mixscape 分析 single-cell pooled CRSIPR screens.。我們介紹新的seurat功能： 計(jì)算每個(gè)細(xì)胞的特異性擾...
IP屬地：臺(tái)灣
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Seurat4.0系列教程17：Mixscape -
單細(xì)胞數(shù)據(jù)分辨率的確定關(guān)于單細(xì)胞分群的分辨率火本，比較常見(jiàn)的方法是使用clustree[http://www.reibang.com/p/f997c2f41c48]张遭，在讀人類(lèi)DCM和HCM的單核細(xì)胞...
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ProjecTILs系列教程（二）：ICB療效預(yù)測(cè)說(shuō)在前面 免疫檢查點(diǎn)抑制劑是腫瘤治療的革命性藥物，然而目前還不清楚為什么一些患者對(duì)檢查點(diǎn)抑制劑療法有反應(yīng)法精，而另一些則沒(méi)有粥谬。在Sade-Feldman等人2018年的一項(xiàng)Cel...
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Seurat：計(jì)算cluster的細(xì)胞比例和繪制堆疊條形圖
計(jì)算各個(gè)cluster的細(xì)胞數(shù)进胯； table(Idents(pbmc)) 定義對(duì)應(yīng)每個(gè)cluster對(duì)應(yīng)的細(xì)胞類(lèi)型伐庭，也可將ident改為相應(yīng)的細(xì)胞類(lèi)型粉渠，計(jì)算每個(gè)細(xì)胞類(lèi)型的細(xì)胞...
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NBIS系列單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)分析實(shí)戰(zhàn)（三）：多樣本數(shù)據(jù)整合第三節(jié)：多樣本數(shù)據(jù)整合 在本節(jié)教程中，我們將探討多個(gè)樣本scRNA-seq數(shù)據(jù)集整合的不同方法圾另。我們使用兩種不同的方法來(lái)校正跨數(shù)據(jù)集的批處理效應(yīng)霸株。同時(shí)，我們還給出一種量化措施...
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R 語(yǔ)言配色收集今天（2020-0430）逛twitter 時(shí)候看到一個(gè)唐大佬的帖子：do you really understand heatmaps? 中有一個(gè)鏈接提到了一篇文獻(xiàn) 20...
