在做三代測(cè)序全長轉(zhuǎn)錄組分析工具調(diào)研時(shí)淆游,記錄一些和三代測(cè)序工作相關(guān)的實(shí)驗(yàn)室和PI勇边,那就先從開發(fā)FLAIR軟件的實(shí)驗(yàn)室開始吧宅粥! Angela N. Brooks 教授 Brook...
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"牛津納米孔技術(shù)公司(Oxford Nanopore Technologies胃夏,ONT)開發(fā)的第三代測(cè)序平臺(tái)是 目前唯一能夠直接對(duì)天然RNA鏈進(jìn)行測(cè)序的技術(shù)平臺(tái)。ONT - ...
Nanopore數(shù)據(jù)分析軟件tomobo Tombo is a suite of tools primarily for the identification of modi...
今天我們介紹一款使用三代全長轉(zhuǎn)錄本數(shù)據(jù)進(jìn)行轉(zhuǎn)錄本校正,聚類秧秉,可變剪切分析,定量和差異分析為一體的工具 - FLAIR[https://flair.readthedocs.io...
The Gviz User Guide[http://www.bioconductor.org/packages/release/bioc/vignettes/Gviz/in...
環(huán)狀RNA(circular RNA衰抑,circRNA)是一類特殊的非編碼RNA(noncoding RNA象迎,ncRNA),也是RNA領(lǐng)域最新的研究熱點(diǎn)呛踊。與傳統(tǒng)的線性RNA(l...
個(gè)人認(rèn)為隨著國內(nèi)第一批PacBio Kinnex full-length RNA測(cè)序數(shù)據(jù)的下機(jī),以及Revio測(cè)序儀的加持谭网,PacBio全長轉(zhuǎn)錄組正式進(jìn)入可定量的時(shí)代汪厨。至此,...
今天我們繼續(xù)介紹一款使用三代全長轉(zhuǎn)錄本數(shù)據(jù)進(jìn)行轉(zhuǎn)錄本注釋和定量的工具 - Bambu[https://github.com/GoekeLab/bambu]愉择。來自新加坡科技研究...