IP屬地：江蘇
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R語(yǔ)言~高級(jí)PCA分析主成分分析啊央，不只需要找到幾個(gè)虛擬但不知具體為何物的主成分因子辈灼，還需要知道我們提供的變量在各個(gè)主成分因子上的載荷（有正有負(fù)）和貢獻(xiàn)度竿裂，以及具體保留多少個(gè)主成分因子才能既盡量保留...
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一篇數(shù)據(jù)挖掘文章的圖表復(fù)現(xiàn)-10.文章 文章標(biāo)題：Characterization of an endoplasmic reticulum stress‐related signature to eval...
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機(jī)器學(xué)習(xí)模型評(píng)價(jià)指標(biāo)(分類)前陣子因?yàn)橹笜?biāo)踩了很多坑,花了很多時(shí)間, 我想還是有必要總結(jié)一下, 梳理一下知識(shí)點(diǎn)啥的... 從classification開(kāi)始說(shuō)起. 只要在網(wǎng)上查一下分類模型評(píng)價(jià)指標(biāo), 基...
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TCGA甲基化數(shù)據(jù)下載以及相關(guān)臨床信息整理之前的文章里已經(jīng)按照教程進(jìn)行了TCGA數(shù)據(jù)庫(kù)的一些練習(xí)（RNA-seq舱污、芯片缸托、生存分析）姥闪，現(xiàn)在學(xué)習(xí)TCGA甲基化數(shù)據(jù)的分析過(guò)程蛔溃。 參考文章：1.甲基化的一些基礎(chǔ)知識(shí)2.Mak...
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2021-03-26 一文教會(huì)你查找基因的啟動(dòng)子匾竿、UTR瓦宜、TSS等區(qū)域以及預(yù)測(cè)轉(zhuǎn)錄因子結(jié)合位點(diǎn)來(lái)源：https://cloud.tencent.com/developer/article/1189476 基礎(chǔ)知識(shí) 首先我們了解一些基礎(chǔ)知識(shí)（注：文中圖片皆可點(diǎn)擊放大查看...
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甲基化套路和甲基化有關(guān)的×胙可以先了解下甲基化：450k甲基化基礎(chǔ)450K甲基化芯片數(shù)據(jù)處理傳送門450k甲基化芯片常用工具包：ChAMP和minfi等临庇。 甲基化的一些預(yù)備知識(shí)甲基化程度...
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PheWAS(全表型組關(guān)聯(lián)分析)----PheWAS的R包測(cè)試及分析(二)
由于上次寫(xiě)完教程一后還有許多疑問(wèn)還沒(méi)解決反璃，在師兄的建議下看了一下R包中核心函數(shù)的源碼(到底在做什么回歸?)，大概解開(kāi)了心中的部分疑惑假夺。最近在看很多問(wèn)題時(shí)候淮蜈，總會(huì)有些急躁，反而...
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文獻(xiàn)閱讀：細(xì)胞異質(zhì)性的表觀遺傳學(xué)基礎(chǔ)這篇文獻(xiàn)是今年的11月發(fā)表在Nature reviews上的一篇綜述已卷，題目是The epigenetic basis of cellular heterogeneity梧田。主要...
