基礎(chǔ)流程（cellranger）(細胞管理員) cellranger 數(shù)據(jù)拆分 cellranger mkfastq可用于將單細胞測序獲得的 BCL 文件拆分為可以識別的 f...
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單細胞分析1（一文讀懂單細胞測序分析流程） -
按照熱圖聚類結(jié)果來給樣本分組1.需求 如圖昼弟，熱圖自帶聚類樹问拘，將樣本(列)分成了三個簇。想要按照聚類的結(jié)果，獲取到 的信息爸舒，并將這個信息添加到熱圖上。 2.作圖的數(shù)據(jù) 輸入數(shù)據(jù)是個表達矩陣，行為基因嫌松，列為...
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樣本相關(guān)性分析，樣本聚類分析
基因課FTP地址：ftp://http://gsx.genek.tv/2020-3-10%E7%9B%B4%E6%92%AD%E4%B8%80%E4%B8%AA%E5%AE%...
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ggplot2繪制GO富集分析柱狀圖1.使用clusterProfiler包進行GO富集分析使用clusterProfiler的enrichGO函數(shù)來獲取GO分析 gene就是差異基因?qū)?yīng)的向量奕污，keyType...
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Excel做兩組矩陣的差異分析
不會R語言萎羔，不會生孩子的Excel也可以做差異分析 1）首先準(zhǔn)備一個矩陣文件，每一列為一個樣本（第一列為基因名）碳默，每一行為一個基因贾陷。 2）新建分組：最好先按分組前后排序缘眶，主要...
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GEO數(shù)據(jù)庫挖掘—生信技能樹B站視頻以下是B站生信技能樹GEO數(shù)據(jù)庫挖掘的課程筆記 主要內(nèi)容及學(xué)習(xí)目的： 介紹GEO數(shù)據(jù)庫：了解數(shù)據(jù)存放位置； 介紹GSE項目的3種下載方式髓废； 介紹ID轉(zhuǎn)換：使用R語言技巧實現(xiàn)基...
