理論部分 該部分參考及引用陳連福的生信講義，zhaofei的https://vip.biotrainee.com/d/103--谍珊。 由于儀器測(cè)序讀長(zhǎng)的限制等企垦，在建庫(kù)時(shí)會(huì)將DN...
IP屬地：北京
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基因組De novo組裝和 ALLPATHS-LG使用 -
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修改stringtie束倍、ballgown 結(jié)果中部分gene_id為ref_gene_id
問題：stringtie組裝轉(zhuǎn)錄本后會(huì)改變?cè)緟⒖蓟蚪M注釋文件中的gene_id stringtie 組裝瀑粥、merge的stringtie_merged.gtf注釋文件中的...
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R語(yǔ)言手動(dòng)計(jì)算Tajima's D 和 Fst原理和公式參考： http://www.reibang.com/p/c7ba1aa543fe[http://www.reibang.com/p/c7ba1aa543fe]...
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R ggplot2繪制堆疊柱狀圖STEP1：了解數(shù)據(jù)特征 STEP2：整理數(shù)據(jù)（變成長(zhǎng)數(shù)據(jù)） STEP3：畫圖 STEP3.1：基本圖形 STEP3.2：改顏色 STEP3.3：改標(biāo)簽 STEP3.4：數(shù)值...
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多行命令并行管理台汇，只需要一個(gè)腳本在上游分析中砾淌，多個(gè)樣本常常要同時(shí)分析即纲，為了節(jié)省時(shí)間我們常常會(huì)通過寫一個(gè)簡(jiǎn)單的腳本去運(yùn)行具帮。 比如對(duì)于這樣的一個(gè)accessionlist，樣本數(shù)較少 我們先寫一個(gè)比對(duì)的腳本 重...
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BSA 操作實(shí)戰(zhàn)
2.1. bwa建立索引文件 bwa index-a bwtsw-p zm437/home/chaim/disk/zm437/Zea_mays.AGPv4.dna.tople...
