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一、轉(zhuǎn)載https://blog.csdn.net/yangl7/article/details/109323644 vcftools --vcf AxiomGT1.call...
1.選擇信號分析—Fst選擇信號分析 概念 Fst:群體間遺傳分化指數(shù)按脚,是種群分化和遺傳距離的一種衡量方法,分化指數(shù)越大歉糜,差異越大乘寒。適用于亞群體間多樣性的比較望众。 用于衡量種群...
1 簡介 BCFtools 是一款多種實用工具的集合,它可以用于處理VCF文件和二進制的BCF文件垫言。它可以接受VCF格式贰剥、壓縮的VCF格式以及BCF格式,并能自動檢測輸入的格...
在拿到一組snp數(shù)據(jù)時筷频,首先應(yīng)該想到要對snp數(shù)據(jù)的質(zhì)量進行檢測和控制蚌成。然后再考慮這組數(shù)據(jù)該怎么分析,如何分析凛捏。snp的質(zhì)控是非常重要的担忧,如果snp數(shù)據(jù)的質(zhì)量不佳,那么計算的...