前言 在前面的一系列WGS文章中入愧，我講述了很多基因數(shù)據(jù)分析的來(lái)龍去脈，雖然許多同學(xué)覺(jué)得很有幫助，但是卻缺了一個(gè)重要的環(huán)節(jié)——沒(méi)有提供實(shí)際可用的數(shù)據(jù)來(lái)實(shí)戰(zhàn)完成具體的流程绳锅，不能得...
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GATK4.0和全基因組數(shù)據(jù)分析實(shí)踐（上） -
如果你做乳腺癌研究潘鲫，請(qǐng)查收這波多組學(xué)數(shù)據(jù)+分析工具
測(cè)序技術(shù)的發(fā)展及數(shù)據(jù)挖掘工具的開(kāi)發(fā)，讓腫瘤診療研究從臨床解剖病理特征模式到分子分型模式肋杖，再到精準(zhǔn)個(gè)體化模式演變溉仑。以“紅顏殺手”乳腺癌為例，最近的研究或多或少都會(huì)涉及多組學(xué)及其...
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TCGA芯片數(shù)據(jù)下載及差異分析
好久沒(méi)更新了状植，最近有點(diǎn)頹浊竟，但是該做的事情還是要繼續(xù)。外包實(shí)驗(yàn)的事情最近搞得頭大津畸，要用一丟丟錢振定，做很多事情，這個(gè)真的是難肉拓，尤其是和公司談判后频，心累。 今天我來(lái)做一下TCGA芯片數(shù)...
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找不到某些GEO數(shù)據(jù)的表達(dá)矩陣腫么辦舉個(gè)栗子帝簇，GSE99410和GSE78200徘郭。 代碼看起來(lái)沒(méi)有問(wèn)題，怎么就畫(huà)不了圖丧肴？ 因?yàn)樗强諗?shù)據(jù)啊残揉。 有兩種情況 第一類，不是芯片數(shù)據(jù)芋浮，用于后續(xù)分析的文件以其他形式存儲(chǔ)了...
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生信工程師找工作的幾點(diǎn)感悟
關(guān)于生信工程師找工作抱环，想到什么就記錄下來(lái)了，可能會(huì)有一些重復(fù)纸巷，無(wú)所謂镇草，自己看明白就好。 疫情影響瘤旨，相關(guān)崗位較少梯啤，能合適匹配的更少。 絕大部分生信崗是NGS應(yīng)用相關(guān)的存哲，最多的是...
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R 語(yǔ)言配色收集今天（2020-0430）逛twitter 時(shí)候看到一個(gè)唐大佬的帖子：do you really understand heatmaps? 中有一個(gè)鏈接提到了一篇文獻(xiàn) 20...
