發(fā)簡(jiǎn)信
IP屬地：湖北
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轉(zhuǎn)錄組分析：預(yù)處理和質(zhì)控記錄一下分析代碼 1. NGS數(shù)據(jù)準(zhǔn)備 2. 參考基因組準(zhǔn)備 對(duì)于模式植物愧沟，可以從多個(gè)方面補(bǔ)充一些注釋信息儒喊，比如GO和KEGG 到這里欢策，原始數(shù)據(jù)...
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R可視化：KEGG富集分析可視化加載R包 加載數(shù)據(jù)集 KEGG富集分析 結(jié)果轉(zhuǎn)換 選取前20項(xiàng)進(jìn)行可視化 給各通路加上對(duì)應(yīng)map號(hào) ggplot2柱狀圖可視化 ggplot2氣...
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R語(yǔ)言保存數(shù)據(jù)框?yàn)镋xcel表格
加載R包 寫(xiě)一個(gè)保存為Excel表格的函數(shù) 保存導(dǎo)出
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本地搭建植物KEGG數(shù)據(jù)庫(kù)及進(jìn)行注釋KEGG數(shù)據(jù)庫(kù)包含豐富的功能信息及通路注釋?zhuān)捎纱肆私馍锵到y(tǒng)的功能和效用涉枫。 而官方已經(jīng)不再免費(fèi)提供FTP下載氨基酸以及核酸序列庫(kù)尺铣，并且KAAS...
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無(wú)參物種背景基因GO注釋
相似的基因在不同物種中描验，其功能往往是保守的占哟。通過(guò)GO注釋可獲得跨物種的同源基因及其基因產(chǎn)物的功能描述。對(duì)于非模式生物或者無(wú)參考基因組的項(xiàng)目翩迈，經(jīng)常...