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CUT-Tag分析CUT-Tag概述 所有發(fā)生在真核生物 DNA 上的動態(tài)過程都發(fā)生在染色質(zhì)中刚梭，包括核小體及其修飾、轉(zhuǎn)錄因子和染色質(zhì)相關復合物饥臂。各種染色質(zhì)特征標記...
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利用R進行數(shù)據(jù)處理一、數(shù)據(jù)讀取 在利用R處理數(shù)據(jù)時似踱，發(fā)現(xiàn)數(shù)據(jù)會有一些缺失隅熙，這時R就會報錯 正如報錯所示，第一行相比于其余行缺一個數(shù)據(jù)核芽，這時我們可以利用 這個函數(shù)跳...
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重新修改單細胞簇的命名
在單細胞分析基本流程中猛们，對單細胞簇命名之后發(fā)現(xiàn)此過程有些錯誤，想要重新命名該如何進行狞洋，以下代碼可以重新將單細胞命名修改為原始分群數(shù)。
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構建系統(tǒng)進化樹如何繪制下圖所示的基因進化樹 實例 以綿羊的NPPC基因為例繪制不同物種間的進化樹1.首先利用NCBI查找NPPC的蛋白序列 2.利用NCBI網(wǎng)...
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如何查看基因的外顯子內(nèi)含子區(qū)基因在結構上绿店，分為編碼區(qū)和非編碼區(qū)兩部分吉懊。真核生物的編碼區(qū)是不連續(xù)的，分為外顯子和內(nèi)含子假勿，在轉(zhuǎn)錄過程中會修剪內(nèi)含子借嗽，并拼合外顯子來形成轉(zhuǎn)錄產(chǎn)物。...
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aspera批量下載測序原始數(shù)據(jù)
下載aspera 軟件官網(wǎng)：asperasoft.com 這一步推薦下載3.9.0以前的版本转培，我下載了最新的版本沒有找到私鑰恶导，下載文件過程中會報...
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轉(zhuǎn)錄組測序分析-上游分析一、認識轉(zhuǎn)錄組 RNA作為基因組和蛋白質(zhì)組之間的鏈接部分浸须，是分子生物學中獨特的核心活動惨寿。轉(zhuǎn)錄組測序是分析某一組織中的全部RNA的表達量邦泄，包括mR...
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fastqc質(zhì)檢結果解讀fastq文件在經(jīng)過fastqc文件質(zhì)檢后，一般都會生成一個網(wǎng)頁版的文件裂垦，我們可以根據(jù)文件來分析我們的測序結果的好壞顺囊，前提是我們能夠讀懂這個文件...