這次只是對數(shù)據(jù)進行了初步的分析丘喻，下次有機會把完整分析過程跑下來??
CUT-Tag分析CUT-Tag概述 所有發(fā)生在真核生物 DNA 上的動態(tài)過程都發(fā)生在染色質(zhì)中餐塘，包括核小體及其修飾邮偎、轉(zhuǎn)錄因子和染色質(zhì)相關復合物。各種染色質(zhì)特征標記了活躍和沉默轉(zhuǎn)錄調(diào)控元件和染色...
IP屬地：重慶
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根據(jù)標準分析流程中組裝的所有轉(zhuǎn)錄本珊燎，生成所有可能的可變剪切事件；請問這樣的話我是否可以用這些可變剪切事件對后面其他所有本物種轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)可變剪切進行分析呢府树？
SUPPA原理及結(jié)果解析
SUPPA是一款強大的轉(zhuǎn)錄本或局部可變剪切分析工具俐末，適用于有多個條件的可變剪切分析，具有靈活奄侠、高效及精準等特點卓箫。SUPPA具有很多操作模塊，每個模塊可以單獨運行垄潮。SUPPA一...
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利用R進行數(shù)據(jù)處理一烹卒、數(shù)據(jù)讀取 在利用R處理數(shù)據(jù)時，發(fā)現(xiàn)數(shù)據(jù)會有一些缺失弯洗，這時R就會報錯 正如報錯所示旅急，第一行相比于其余行缺一個數(shù)據(jù)，這時我們可以利用 這個函數(shù)跳過第一行牡整，但大多數(shù)據(jù)并不是僅僅...
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重新修改單細胞簇的命名
在單細胞分析基本流程中藐吮，對單細胞簇命名之后發(fā)現(xiàn)此過程有些錯誤，想要重新命名該如何進行逃贝，以下代碼可以重新將單細胞命名修改為原始分群數(shù)谣辞。
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構建系統(tǒng)進化樹如何繪制下圖所示的基因進化樹 實例 以綿羊的NPPC基因為例繪制不同物種間的進化樹1.首先利用NCBI查找NPPC的蛋白序列 2.利用NCBI網(wǎng)站對NPPC蛋白進行blast...
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如何查看基因的外顯子內(nèi)含子區(qū)基因在結(jié)構上，分為編碼區(qū)和非編碼區(qū)兩部分沐扳。真核生物的編碼區(qū)是不連續(xù)的泥从，分為外顯子和內(nèi)含子，在轉(zhuǎn)錄過程中會修剪內(nèi)含子沪摄，并拼合外顯子來形成轉(zhuǎn)錄產(chǎn)物躯嫉。在原核生物中纱烘，基因是連續(xù)的，也...
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@神經(jīng)蛙_3abe 可以兩兩比較
單細胞不同組別進行差異基因分析
大家做單細胞項目的時候祈餐，會涉及到多個組別擂啥，在分群之后想進行不同組別的差異基因分析，來查看不同處理對試驗有什么影響帆阳。但生信小白只會流程化的分析啤它，在對兩組之間的單細胞進行差異分析...
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aspera批量下載測序原始數(shù)據(jù)
下載aspera 軟件官網(wǎng)：asperasoft.com 這一步推薦下載3.9.0以前的版本，我下載了最新的版本沒有找到私鑰舱痘，下載文件過程中會報錯。 查看軟件 1.軟件下載至...
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轉(zhuǎn)錄組測序分析-上游分析一离赫、認識轉(zhuǎn)錄組 RNA作為基因組和蛋白質(zhì)組之間的鏈接部分芭逝，是分子生物學中獨特的核心活動。轉(zhuǎn)錄組測序是分析某一組織中的全部RNA的表達量渊胸，包括mRNA,rRNA,tRNA,ln...
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fastqc質(zhì)檢結(jié)果解讀fastq文件在經(jīng)過fastqc文件質(zhì)檢后胖翰，一般都會生成一個網(wǎng)頁版的文件，我們可以根據(jù)文件來分析我們的測序結(jié)果的好壞切厘，前提是我們能夠讀懂這個文件中顯示的內(nèi)容萨咳，接下來我們主要解...
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老師好，不同測序平臺的數(shù)據(jù)可以整合嘛疫稿？
10X單細胞轉(zhuǎn)錄組多物種聯(lián)合分析：以人和小鼠為例
10X單細胞轉(zhuǎn)錄組是可以聯(lián)合分析多個物種的培他。也許，你會問為什么要分析多個物種遗座，我一個物種的某個器官還整明白呢舀凛？其實在做： 模型 移植 免疫 病毒 生殖隔離 的時候，同一個組織...
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@小劉同學lls 是的
單細胞不同組別進行差異基因分析
大家做單細胞項目的時候途蒋，會涉及到多個組別猛遍，在分群之后想進行不同組別的差異基因分析，來查看不同處理對試驗有什么影響号坡。但生信小白只會流程化的分析懊烤，在對兩組之間的單細胞進行差異分析...
