scVelo于2020年發(fā)表在Nature Biotechnology[https://www.nature.com/articles/s41587-020-0591-3]讹挎，...
發(fā)簡(jiǎn)信
IP屬地：浙江
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使用scVelo進(jìn)行RNA velocity分析-01 -
TCGA數(shù)據(jù)差異分析后生存分析（批量單因素cox回歸/Lasso篩選，多因素cox建模躁锡，時(shí)間依賴ROC曲線及KM plot可視化）測(cè)序上游分析系列： mRNA-seq轉(zhuǎn)錄組二代測(cè)序從raw reads到表達(dá)矩陣：上中游分析pipelinemiRNA-seq小RNA高通量測(cè)序pipeline：從raw r...
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Python腳本：fasta文件多序列信息統(tǒng)計(jì)
設(shè)計(jì)需求 統(tǒng)計(jì)fasta文件中多條序列信息午绳，設(shè)計(jì)目標(biāo)效果： 將結(jié)果輸入到csv格式的表格中，因?yàn)閏sv格式表格用稚铣，分隔數(shù)據(jù)箱叁。腳本使用argparse模塊墅垮，提示輸入數(shù)據(jù)。 讀取...
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SNP數(shù)據(jù)構(gòu)建系統(tǒng)進(jìn)化樹(shù)大概是長(zhǎng)期的不鍛煉使得今天的爬山運(yùn)動(dòng)過(guò)量了耕漱，接著悲劇就是無(wú)法入眠算色。也幸虧明天是周日，干脆就起床碼字了螟够≡置危總結(jié)下自己前面用snp構(gòu)建系統(tǒng)進(jìn)化樹(shù)的方法吧。 1.構(gòu)建進(jìn)化樹(shù)的算法 構(gòu)...
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學(xué)習(xí)WES數(shù)據(jù)分析流程
參考學(xué)習(xí)資料：筆記視頻教程知識(shí)庫(kù) 首先安裝軟件 先安裝conda妓笙，使用清華的conda若河，說(shuō)明書(shū)：https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/he...
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近乎全文翻譯：在單細(xì)胞水平上構(gòu)建人類細(xì)胞景觀圖譜Construction of a human cell landscape at single-cell level 2020年發(fā)表在nature上，這篇文章是我兩個(gè)月之前...
