在前面兩篇文章中腻脏，我們著重介紹了 Cell Ranger 進(jìn)行基因比對的理論模型以及如何識別高質(zhì)量細(xì)胞算法鸦泳，這兩部分是基礎(chǔ)，正所謂溫故而知新永品，大家可以點擊如下鏈接進(jìn)行復(fù)習(xí)： ...
發(fā)簡信
IP屬地：上海
-
Cellranger原理介紹（下）
-
Cellranger原理介紹（中）
在上篇文章中做鹰，我們著重介紹了Cell Ranger 進(jìn)行基因比對的理論模型，還不太清楚的同學(xué)可以點擊鏈接進(jìn)行回顧：【 Cell Ranger 知多少（上）[http://mp...
-
Cellranger原理介紹（上）
Cell Ranger 軟件是 10X genomics 官方提供的配套分析軟件鼎姐，相信使用過 10X genomics 平臺進(jìn)行單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組測序數(shù)據(jù)分析的老師們對它一定不陌生...
-
Cell | 單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組揭示肝實質(zhì)細(xì)胞及肺實質(zhì)細(xì)胞的早期細(xì)胞譜系Cell | 單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組揭示肝實質(zhì)細(xì)胞及肺實質(zhì)細(xì)胞的早期細(xì)胞譜系 原文題目：Single-Cell Transcriptomics Reveals Early Emerge...
-
課程會在2019年9月底之前錄制完畢并上線： 課程說明在：https://mp.weixin.qq.com/s/AV2uTbsvJGBRq_zv7yDmNg 所有代碼在：https://github.com/jmzeng1314/scRNA_smart_seq2 觀看鏈接 手機(jī)微信觀看（推薦）：http://jm.grazy.cn/wechat/course/detail?cid=53 電腦瀏覽器的鏈接 http://jm.grazy.cn/index/mulitcourse/detail.html?cid=53
-
seurat 對象中的 counts 轉(zhuǎn)成稀疏矩陣barcodes.tsv.gz症见、features.tsv和matrix.mtx.gz三個文件
所使用的R包：DropletUtils 函數(shù)：write10xCounts
