240 發(fā)簡(jiǎn)信
IP屬地:四川
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    VCF格式

    劉小澤寫(xiě)于18.7.17所有的數(shù)據(jù),一旦要找變異位點(diǎn)信息,就離不開(kāi)VCF。豆豆也是在寫(xiě)一個(gè)重測(cè)序的操作流程,遇到了VCF文本蹲坷,之前也是沒(méi)有了解過(guò),這次再多學(xué)一個(gè)格式官方最新說(shuō)...

  • GATK4 多個(gè)樣本GenotypeGVCFs前用 CombineGVCFs還是GenomicsDBImport

    我們知道,GATK 4 多個(gè)樣本joint genotyping用模塊GenotypeGVCFs, 目前GenotypeGVCFs只支持以下三種形式的輸入文件:1)a sin...

  • Freebayes Call SNP

    轉(zhuǎn)載文章级解,原文地址:http://www.bioinfo-scrounger.com/archives/254Freebayes身為眾多call變異軟件中的一員,一直被使用到...

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    2. BSA的原理

    BSA(Bulked Segregant Analysis)田绑,集群分離分析或分離群體分組分析法勤哗。兩個(gè)特點(diǎn):1. 混池2. 性狀分離所以,BSA可以稱之為分析有性狀分離的群體分...

  • python生信小練習(xí)(三)

    生信菜鳥(niǎo)團(tuán)的編程練習(xí): 對(duì)FASTQ的操作 5,3段截掉幾個(gè)堿基 序列長(zhǎng)度分布統(tǒng)計(jì) FASTQ 轉(zhuǎn)換成 FASTA 統(tǒng)計(jì)堿基個(gè)數(shù)及GC%對(duì)FASTA的操作 取互補(bǔ)序列 取反向...

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