@醫(yī)學和生信筆記 哈哈哈哈我剛看到評論铣墨，這么說我拍霜，我太不服氣了浓体，立馬怒沖沖打開R砰左，結(jié)果利索裝上了??
新版TCGA的突變SNP數(shù)據(jù)下載和整理關于TCGAbiolinks包的學習前面一共介紹了5篇推文鼠哥。 今天繼續(xù)學習如何使用TCGAbiolinks下載和整理MAF格式的突變數(shù)據(jù)誓篱。 之前的TCGA的MAF文件是可以下...
IP屬地：云南
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但是安裝TCGAbiolinks一直出錯皮壁，dependency包已經(jīng)從CRAN remove掉了
新版TCGA的突變SNP數(shù)據(jù)下載和整理
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不用盲猜饶深，看看count2TPM的源代碼就知道有沒有l(wèi)og的計算；并且逛拱，如果有0會報錯敌厘，像UCSC上那樣log2（x+1）處理之后，0的地方還是0朽合，不還是一樣會報錯俱两？
【R>>IOBR】counts轉(zhuǎn)TPM
分析測序數(shù)據(jù)時，常常需要將counts數(shù)據(jù)轉(zhuǎn)換為TPM格式曹步，而這個轉(zhuǎn)變過程就需要涉及每個基因的長度宪彩，幸好有專業(yè)人士已經(jīng)幫我們處理好這個東東，我們可以一鍵進行操作讲婚。首先來認識下...