滿月拋江第三難 基因集的概念GSEA全稱Gene Set Enrichment Analysis比勉,GSVA全稱Gene Set Variation Analysis碟渺,它們都是...
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GSEA分析根據(jù)測(cè)序公司返回來(lái)的分析數(shù)據(jù)月杉,打開(kāi)包含所有基因的數(shù)據(jù)的excel表 在excel 表中先進(jìn)行部分操作 去除不含EntrezID的行糖儡,通過(guò)篩選去掉空的列 只保留ge...
如果你覺(jué)得GO或KEGG不夠解釋斗躏,或許可以試試GSEA 具體內(nèi)容參考這篇[https://blog.csdn.net/weixin_45822007/article/deta...
目前做GSEA主要有兩種辦法柱告,一種是使用GSEA的java軟件层释,另一種是使用R語(yǔ)言包婆瓜,當(dāng)時(shí)還有在線的工具做GSEA的數(shù)據(jù)也有兩種,一種是有基因表達(dá)矩陣和分組贡羔,另一種是使用兩列...
富集分析 基因富集分析(gene set enrichment analysis)是在一組基因或蛋白中找到一類過(guò)表達(dá)的基因或蛋白廉白。研究方法可分為三種:Over-Repress...
ggplot2繪圖理念 圖形系統(tǒng)的核心理念是把繪圖與數(shù)據(jù)分離,把數(shù)據(jù)相關(guān)的繪圖與數(shù)據(jù)無(wú)關(guān)的繪圖分離乖寒,按圖層作圖猴蹂。ggplot2可以把繪圖拆分成多個(gè)圖層,且能夠按照順序創(chuàng)建多重...
這是我聽(tīng)B站鯪魚(yú)不會(huì)飛視頻(GO,KEGG逐虚,DO富集分析)里的筆記哦~當(dāng)然有的地方加上的是我自己的理解聋溜,如果哪里和視頻上講的不一樣那是我自己發(fā)揮的,自行忽略.... 市面上公...