問題 安裝R包（seqinr）時遇到以下問題（缺少config文件）： 從報錯信息可以看出報錯根本原因是找不到zlib.h 問題解決： 1铅碍，確認(rèn)是否安裝zlib 注：上述命令...
發(fā)簡信
IP屬地：江西
-
安裝R包 fatal error: zlib.h: No such file or directory 問題解決
-
-
正則表達(dá)式手冊前言 正則在實際中太多時候用到了莱衩，但還沒有系統(tǒng)梳理過，這周學(xué)了一些正則參考實際經(jīng)常用到的寫一個簡單的手冊娇澎。 基礎(chǔ) 字符組 正則解釋[aA]字符組[] 允許匹配一組可能出現(xiàn)的字...
-
生者為過客笨蚁，死者為歸人–讀《誰在銀閃閃的地方，等你》在華人的世界里趟庄，大家都愿意歌頌生括细，卻忌諱談?wù)撍馈Ｉ窍Ｍ萆叮茄永m(xù)奋单，死是不可知的恐怖。 因為恐怖猫十，所以焦慮览濒。身體健康時，擔(dān)心會得病拖云，得了病以后贷笛，擔(dān)心會死亡。我們急于逃離死亡的陰...
-
TCGA|GEO可視化分析第1篇---相關(guān)性分析導(dǎo)讀：今天有小伙伴問我，篩選完差異基因后尤筐，想看自己關(guān)注的基因和其他基因的關(guān)系汇荐，應(yīng)該怎么做？那當(dāng)然要先做一下相關(guān)性分析了盆繁！好掀淘，下面讓我給大家娓娓道來...... 正文： ste...
-
【R>>ggprism】Graphpad Prism繪圖風(fēng)格做科研的Graphpad Prism是避不開的一道關(guān)繁疤，那么是否可以用R來實現(xiàn)其繪圖風(fēng)格呢？在微信公眾號例竟然發(fā)現(xiàn)一篇好文秕狰，《一行代碼繪制Graphpad Prism風(fēng)格學(xué)術(shù)表...
-
【R>>配對樣本】提取TCGA中的配對樣本
腫瘤研究中稠腊，常常需要關(guān)注癌和癌旁組織，這個時候就需要找出這些配對樣本鸣哀。下面就來實戰(zhàn)吧架忌！ 1.下載counts數(shù)據(jù)轉(zhuǎn)為TPM counts轉(zhuǎn)TPM教程：【R>>IOBR】cou...
-
【R>>DepMap】單基因腫瘤細(xì)胞表達(dá)情況CCLE是腫瘤細(xì)胞基因表達(dá)的百科全書，之前寫CCLE：求任意基因的相關(guān)性[http://www.reibang.com/p/59f979ab09ee]稍微介紹過其用法我衬。今天...
-
CCLE：求任意基因的相關(guān)性進(jìn)行腫瘤的研究雹嗦，求兩個或多個基因的相關(guān)性，可以用GEPIA2或者直接下載數(shù)據(jù)用R語言處理合是，如果能再加上細(xì)胞系的相關(guān)性就能完美了了罪。下面就分享下，手動下載CCLE測序數(shù)據(jù)聪全，求任意...
-
單基因TCGA的Cox森林圖怎么畫才好看首先調(diào)取Xena網(wǎng)頁的TCGA數(shù)據(jù)做Cox生存分析泊藕，數(shù)據(jù)可以通過hiplot官網(wǎng)自主研發(fā)的ucsc-xena-shiny直接在線獲取訪問https://hiplot.com....
-
TCGA+biomarker——Cox回歸森林圖
森林圖簡介 森林圖（forest plot）鹤竭，從定義上講踊餐，它一般是在平面直角坐標(biāo)系中，以一條垂直于X軸的無效線（通常坐標(biāo)X=1或0）為中心臀稚，用若干條平行于X軸的線段，來表示每...
-
-
單基因的腫瘤細(xì)胞系表達(dá)怎么看？CCLE告訴你泛癌的基因表達(dá)量一般可以用TCGA和GTEx實現(xiàn)散劫，但是腫瘤細(xì)胞系一般用CCLE臨床生信之家[https://www.aclbi.com/static/index.html#/...
個人介紹
一個永遠(yuǎn)永遠(yuǎn)不拋棄不放棄、積極常熙、樂觀纬乍、向上、青春裸卫、機(jī)智仿贬、勇敢、堅強(qiáng)的女孩子墓贿。