240 發(fā)簡(jiǎn)信
IP屬地:浙江
  • @無(wú)理_ad7a 可能網(wǎng)絡(luò)問(wèn)題捎废,我也會(huì)經(jīng)常失敗舒萎。

    轉(zhuǎn)錄組入門(8):差異基因結(jié)果注釋

    作業(yè)要求 我們統(tǒng)一選擇p<0.05而且abs(log2FC)大于1的基因?yàn)轱@著差異表達(dá)基因集曹洽,對(duì)這個(gè)基因集用R包做KEGG/GO超幾何分布檢驗(yàn)分析鳍置。然后把表達(dá)矩陣和分組信息分...

  • @9a8ab6bc59dc 可能gff注釋文件的原因。

    TBtools中關(guān)于染色體定位的問(wèn)題

    我說(shuō)明一下送淆,很多時(shí)候我只是喜歡放圖税产,不一定和內(nèi)容有關(guān)聯(lián),只是喜歡偷崩。 我們?cè)谶M(jìn)行染色體繪制的時(shí)候辟拷,會(huì)出現(xiàn)問(wèn)題,比如沒(méi)法出圖阐斜。今天我就遇到了這樣一個(gè)問(wèn)題衫冻,最后我檢查了一下,發(fā)現(xiàn)就...

  • match()和unique()R包連用

    下面這樣一條代碼智听,我都看來(lái)半天羽杰,還一直整不明白,真的才發(fā)現(xiàn)注釋每個(gè)代碼是有多么重要到推。 首先是unique()函數(shù)考赛,將lh變量中的重復(fù)項(xiàng)刪除 第二步,通過(guò)match()函數(shù)莉测,將...

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    str_replace()函數(shù)使用

    在處理大量數(shù)據(jù)的時(shí)候颜骤,有些數(shù)據(jù)觀測(cè)值不符合要求或者說(shuō)有特殊字符,要進(jìn)行處理捣卤。今天使用了stringrR包中的函數(shù)str_replace()和str_replace_all()...

  • R包的移除

    今天遇到了一個(gè)之前沒(méi)考慮過(guò)的問(wèn)題忍抽,library()載入的R包如何移除,之前只會(huì)載入董朝,今天想要移除R包鸠项。我們使用detach("package:plyr",unload = ...

  • head()函數(shù)

    head()函數(shù)是查看向量,矩陣或數(shù)據(jù)框等數(shù)據(jù)的部分信息子姜,它默認(rèn)輸出數(shù)據(jù)框前6行數(shù)據(jù)祟绊,與其相對(duì)的是tail(),查看的是數(shù)據(jù)框最后的6行數(shù)據(jù)。兩者都可以添加一個(gè)參數(shù)n來(lái)控制顯...

  • summary()函數(shù)

    summary函數(shù)是描述性統(tǒng)計(jì)分析牧抽,對(duì)于連續(xù)型變量(可以呈現(xiàn)為某個(gè)范圍內(nèi)的任一值嘉熊,并同時(shí)表示順序和數(shù)量。年齡就是這樣的例子扬舒。)阐肤,它會(huì)依次提供最大值,1/4分位數(shù)讲坎,中位數(shù)孕惜,平均...

  • R數(shù)據(jù)整理方法

    R整理數(shù)據(jù) 整齊的(經(jīng)過(guò)整理的)數(shù)據(jù)資料可以方便地被操作、建模和可視化處理衣赶,而且擁有特定的結(jié)構(gòu)(Tidy data诊赊,整潔數(shù)據(jù)): 每個(gè)變量是一列 每個(gè)觀測(cè)值是一行 每個(gè)單元格...

  • read.csv 與read_csv差異

    都是用來(lái)讀取CSV格式的文件,但是read_csv讀取文件后會(huì)保持原始數(shù)據(jù)的列名稱府瞄,并且會(huì)將數(shù)據(jù)轉(zhuǎn)換成tbl_df格式碧磅,其余的就和read.csv作用一樣。

  • R操作符——%in%

    該%in%操作符就是左邊去匹配右邊的遵馆,然后匹配到就是TRUE鲸郊,否則就是FALSE。實(shí)際在dplyr中的應(yīng)用:

  • @古城西里 那你就需要手動(dòng)編輯你的多序列比對(duì)結(jié)果货邓。將其修剪成相同長(zhǎng)度

    HMMER3.1使用

    最近在探索全基因組基因家族的分析方法秆撮,而找到某一家族需要通過(guò)保守結(jié)構(gòu)域來(lái)預(yù)測(cè),從而找到物種的某一基因家族换况,從而進(jìn)行之后的分析职辨。這里就需要用到HMMER3.1軟件,鑒定物種某一...

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    轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)上傳到SRA

    轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)上傳教程(SRA) 為什么要上傳 我們?cè)谕陡逯岸家褦?shù)據(jù)上傳才能發(fā)表戈二。但是舒裤,數(shù)據(jù)上傳如果不知道一些套路的話,會(huì)很麻煩觉吭。筆者曾經(jīng)在博士期間被轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)上傳弄得焦頭爛...

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    Web自動(dòng)化(5):通過(guò)CSS選擇器根據(jù)tag名腾供、id和class選擇元素

    CSS選擇器直接通過(guò)tag名選擇元素 根據(jù)id來(lái)選擇元素 語(yǔ)法是需要在id之前加上#,#id 根據(jù)class屬性選擇元素 語(yǔ)法是需要在class屬性值之前加上一個(gè)點(diǎn):.class值

  • 指針變量

    指針變量是一種特殊的變量鲜滩,它不是用來(lái)放數(shù)據(jù)的伴鳖,而是用來(lái)存放另一種變量的地址。這個(gè)變量就是指針?biāo)赶虻哪繕?biāo)變量徙硅。我們常把指針變量簡(jiǎn)稱為指針榜聂。可以理解為間接的存放數(shù)據(jù)嗓蘑,通過(guò)中間的...

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    C語(yǔ)言——數(shù)據(jù)類型

    寫在前面 圖中是C語(yǔ)言的所有數(shù)據(jù)類型峻汉,在計(jì)算機(jī)中贴汪,數(shù)據(jù)是存儲(chǔ)在計(jì)算機(jī)中的一個(gè)個(gè)單元里面,它是具體存在的休吠。而且,存儲(chǔ)單元是由有限的字節(jié)構(gòu)成的业簿,每一個(gè)存儲(chǔ)單元存儲(chǔ)的數(shù)據(jù)是有限的瘤礁,...

  • C語(yǔ)言——變量

    定義 變量代表一個(gè)有名字的、具有特殊屬性的存儲(chǔ)單元梅尤。它可以用來(lái)保存數(shù)據(jù)柜思,變量的值是可以改變的。一般C語(yǔ)言中變量形式:<類型名稱><變量名稱> int a; int b; in...

  • Python內(nèi)置函數(shù)(2)——round()

    使用表達(dá)式 round(number[, ndigits]) 函數(shù)解釋使用 number是你的數(shù)巷燥,可以是整數(shù)赡盘,小數(shù),負(fù)數(shù)缰揪。 ndigits是舍入到小數(shù)點(diǎn)后的位數(shù)陨享,可以省略,則...

  • C語(yǔ)言——常量

    不能被改變的量就是常量钝腺,類型有一下幾種: 整型常量: 0抛姑,100,30艳狐,-45都是整型常量定硝。 實(shí)型常量:就是我們常說(shuō)的小數(shù),小數(shù)還可以用指數(shù)形式表現(xiàn)毫目。由于計(jì)算機(jī)無(wú)法表示上角和...

  • Python內(nèi)置函數(shù)(1)——divmod()

    官網(wǎng)說(shuō)得很明確蔬啡,就是兩個(gè)數(shù)字作為參數(shù),進(jìn)行算術(shù)運(yùn)算镀虐。我通過(guò)例子進(jìn)行明確其功能箱蟆。 對(duì)于整數(shù)來(lái)說(shuō) 就是簡(jiǎn)單的取整和取余 對(duì)于浮點(diǎn)數(shù)

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植物逆境營(yíng)養(yǎng)博士生,
喜歡折騰編程方面的東西粉私,
愛(ài)好攝影顽腾,偶爾喜歡裝文藝。
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