在簡(jiǎn)書日更文05-2蚪腋，第二輪窒典，每天至少100字 https://colorsupplyyy.com/app/ 兩種配色三種配色鄰近色配色對(duì)比配色先學(xué)習(xí)基本的配色方案 http...
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如何使用GEOquery和limma完成芯片數(shù)據(jù)的差異表達(dá)分析如何分析芯片數(shù)據(jù) 我最早接觸的高通量數(shù)據(jù)就是RNA-seq轩褐，后來(lái)接觸的也基本是高通量測(cè)序結(jié)果而不是芯片數(shù)據(jù)顺少，因此我從來(lái)沒有分析過一次芯片數(shù)據(jù)酌摇，而最近有一個(gè)學(xué)員在看生信技能樹在...
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基因表達(dá)分析（上）- 差異表達(dá)分析基因表達(dá) 什么是基因表達(dá)鉴吹，如下是來(lái)自于維基百科的解釋： 研究方法 定量PCR 這部分我不太懂，所以就放幾段百度百科和維基百科的定義。 百度百科 定量PCR（即時(shí)聚合酶鏈鎖反應(yīng)...
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典型醫(yī)學(xué)設(shè)計(jì)實(shí)驗(yàn)GEO數(shù)據(jù)分析 (step-by-step) - 數(shù)據(jù)獲取到標(biāo)準(zhǔn)化GEO是當(dāng)今最大闷供、最全的公共基因數(shù)據(jù)資源庫(kù)烟央，包括基因的表達(dá)、突變歪脏、修飾等信息疑俭，涵蓋幾乎所有的疾病，且單個(gè)實(shí)驗(yàn)檢測(cè)樣品數(shù)目較多婿失，是我們分析怠硼、學(xué)習(xí)的很好資源。 實(shí)驗(yàn)設(shè)計(jì) 原始文章...
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GEO數(shù)據(jù)挖掘視頻筆記
項(xiàng)目總覽 第一個(gè)視頻主要是項(xiàng)目總覽移怯，介紹了整個(gè)課程的結(jié)構(gòu)，每一講主要要講得東西这难，介紹了jimmy的github形式的教學(xué)舟误，學(xué)員可以在clone or download里dow...
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呦呦切克鬧，WGCNA來(lái)一套劉小澤寫于18.10.10很早就見過它姻乓，但只是不明覺厲嵌溢，直到昨天才開始認(rèn)真了解是這樣的：昨天上午看了一篇文獻(xiàn)，講冠心病的基因共表達(dá)分析蹋岩，簡(jiǎn)而言之就是把得到的幾千個(gè)變化比較大的...
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WGCNA+代碼實(shí)戰(zhàn)（持續(xù)補(bǔ)充中）什么是WGCNA 1 樣本聚類赖草，查看是否有離群值 2. 找構(gòu)建網(wǎng)絡(luò)合適的閾值 左圖縱軸：相關(guān)系數(shù)的平方，越高說(shuō)明該網(wǎng)絡(luò)越逼近無(wú)網(wǎng)絡(luò)尺度的分布剪个。右圖縱軸：Connectivit...
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WGCNA分析秧骑，簡(jiǎn)單全面的最新教程本文應(yīng)該是第二全的WGCNA分析教程，參考了最新的文檔扣囊。第一全的還在路上乎折，會(huì)出現(xiàn)于生信寶典和宏基因組公眾號(hào)組織的二代三代轉(zhuǎn)錄組測(cè)序分析實(shí)戰(zhàn)班上，歡迎點(diǎn)擊鏈接了解更多侵歇。 WGC...
