先使用bowtie2軟件自帶的測試數(shù)據(jù)生成sam/bam文件凛捏,代碼如下: 1.統(tǒng)計共多少條reads(pair-end reads這里算一條)參與了比對參考基因組 2.統(tǒng)計共...
這個是有機結(jié)合生物信息學(xué)的linux和數(shù)據(jù)格式的練習(xí)題: 下載bowtie2軟件后拿到示例數(shù)據(jù): 1.統(tǒng)計reads_1.fq 文件中共有多少條序列信息 2.輸出所有的rea...
sed 是一種流編輯器坎拐,它一次處理一行內(nèi)容烦磁。 處理時养匈,把當前處理的行存儲在稱為“模式空間”(pattern space)的臨時緩沖區(qū)中,接著用 sed 命令處理緩沖區(qū)中的內(nèi)容...
1.在任意文件夾下面創(chuàng)建形如 1/2/3/4/5/6/7/8/9 格式的文件夾系列。 2.在創(chuàng)建好的文件夾下面陨晶,比如我是/Users/jimmy/tmp/1/2/3/4/5/...