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方法一:基于hmm模型的鑒定方法 1.準(zhǔn)備數(shù)據(jù)①下載擬南芥基因組fasta文件葛峻、注釋文件gtf/gff3文件:ftp://ftp.ensemblgenomes.org/pub...
寫在前面 通常我們碰到的是锹雏,根據(jù)gff文件提取cDNA序列,這個(gè)比較容易滿足术奖,但是有時(shí)候我們需要構(gòu)建native promoter 載體的時(shí)候礁遵,就需要提取cDNA前面的序列,...
寫在前面要讓從基因組中獲取信息變得像喝水那樣簡單佣耐。 --by zhougengxu 預(yù)先準(zhǔn)備 我以水稻基因組為例,像大家介紹如何提取序列挺庞。 基因組文件:水稻基因組晰赞,水稻...
應(yīng)實(shí)驗(yàn)室同學(xué)的需求,為了減輕他們計(jì)算結(jié)果的工作量,來編寫了以下的R語言代碼掖鱼,利用單因素方差分析(多重比較分析)分析qPCR的Ct值然走,并繪制表達(dá)量柱狀圖。 方差分析用于兩個(gè)及兩...