常用的細(xì)胞通訊軟件：CellphoneDB[http://www.reibang.com/p/38a9376f5286]：是公開的人工校正的，儲(chǔ)存受體掀亩、配體以及兩種相互作用...
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單細(xì)胞分析之細(xì)胞交互-3：CellChat -
環(huán)境配置筆記7-解決hdf5r安裝時(shí)遇到的無數(shù)的坑
安裝hdf5r包時(shí)報(bào)錯(cuò)： checking for h5cc... no checking for h5pcc... no checking for HDF5 librari...
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文獻(xiàn)學(xué)習(xí)023--[sc]腫瘤浸潤髓系細(xì)胞的pan-cancer單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄圖譜張澤民老師2021年2月份發(fā)表在cell上的文章 Tumor-infiltrating myeloid cells (TIMs) 是腫瘤進(jìn)展的關(guān)鍵調(diào)解者舔哪，但是它們?cè)诓煌[瘤間...
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詳細(xì)介紹新版SingleR進(jìn)行單細(xì)胞自動(dòng)化鑒定
作者：堯小飛審稿：童蒙編輯：amethyst 引言 隨著10xGenomics單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組技術(shù)的普及，現(xiàn)在的單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組分析越來越普及槽棍，得到的單細(xì)胞數(shù)據(jù)越來越多捉蚤。然而單細(xì)胞轉(zhuǎn)...
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免疫細(xì)胞注釋-2：髓系細(xì)胞scRNAseq免疫細(xì)胞注釋： 免疫細(xì)胞注釋-1：T細(xì)胞[http://www.reibang.com/p/0127c9b380c9] 免疫細(xì)胞注釋-2：髓系細(xì)胞[http...
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基礎(chǔ)知識(shí)--增強(qiáng)子基礎(chǔ)知識(shí)--增強(qiáng)子 一、定義 增強(qiáng)子(Enhancer) 又可譯為強(qiáng)化子炼七，是DNA上一小段可與蛋白質(zhì)結(jié)合的區(qū)域缆巧，與蛋白質(zhì)結(jié)合之后，基因的轉(zhuǎn)錄作用將會(huì)加強(qiáng)豌拙。增強(qiáng)子可能位于基因上...
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2022-10-18Cancer Cell | AI集成腫瘤多模態(tài)數(shù)據(jù)：數(shù)據(jù)融合和關(guān)聯(lián)發(fā)現(xiàn) 原創(chuàng)huacishu圖靈基因2022-10-18 10:11發(fā)表于江蘇 收錄于合集#前沿生物大數(shù)據(jù)分析...
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免疫基因組指標(biāo)的計(jì)算（6個(gè)）1.Mutation load 腫瘤突變負(fù)荷 2.新抗原負(fù)荷（Neoantigen load） 配對(duì)樣本的全外的.bam數(shù)據(jù)陕悬，第一步通過POLYSOLVER tool工具對(duì)每...
