發(fā)簡(jiǎn)信
IP屬地：河北
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使用bcftools提取vcf文件中的特定信息
可以使用工具 bcftools 中的 view 命令結(jié)合選項(xiàng) -r 和 -s 來(lái)挑選特定的 SNP 位點(diǎn)窘拯。 選擇感興趣的樣本，使用 -s 選項(xiàng)，...
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問(wèn)題匯總（持續(xù)更新）R 1. plot()后并不能進(jìn)行繪圖 直接輸入dev.new()即可解決問(wèn)題 2. 在Linux上，R包安裝不上的情況 以后直接用conda安...
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pheatmap的基本使用pheatmap是R語(yǔ)言中繪制熱圖的一個(gè)非常流行的包，通過(guò)設(shè)置不同的參數(shù)能夠畫(huà)出精美的圖。因此，本文章介紹一些pheatmap的一些基礎(chǔ)用法烟央，以...
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提取出Seurat中的umap信息用ggplot繪圖1. 導(dǎo)出數(shù)據(jù) 2. 繪圖 結(jié)果如下所示
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使用hclust以及ggtree進(jìn)行層次聚類(lèi)可視化1. 首先讀取數(shù)據(jù) 2. 數(shù)據(jù)處理 3. hclust聚類(lèi) 4. 使用cutree對(duì)樹(shù)進(jìn)行修建及分組 5. 使用ggtree繪制圈圖
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處理數(shù)據(jù)過(guò)程中的一些小技巧（持續(xù)更新）
Linux 以列為單位合并兩個(gè)文件 使用awk提取文件中某兩列有多少相同元素 使用awk提取文件中第一行中包括特定元素的字符串所對(duì)應(yīng)的列的內(nèi)容 ...
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seqtk_demultiplex的使用
本文中轉(zhuǎn)自根據(jù)Barcode序列拆分fastq文件[https://www.plob.org/article/14515.html] seqtk...
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fastq-multx的使用
文章轉(zhuǎn)自 根據(jù)Barcode序列拆分fastq文件[https://www.plob.org/article/14515.html]seqtk_...
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轉(zhuǎn)錄組下游分析——DEG和GO富集分析
??在進(jìn)行上游的轉(zhuǎn)錄組分析后，我們會(huì)得到基因的計(jì)數(shù)文件歪脏。通過(guò)該文件疑俭，我們可以進(jìn)行下游的DEG分析，獲得不同樣本的差異表達(dá)基因婿失，并可以將這些基因富...